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基因ID、cds ID与蛋白ID三者均不一致

没有规律也可以分析的,可以使用  geneID2mRNA.pl 脚本找到ID之间的对应关系;  然后一个基因挑一个转录本作为代表序列;https://www.omicsclass.com/article/2032 或者用这个:https://www.omicsclass.com/article/2032  新版基因家族课程已经更新这部分内容:https://bdtcd.xet.tech/s/1BAqPp

回答于 2020-03-26 13:27

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老师您好,挂载文件夹失败,这种情况是什么导致的呀,开始我下了...

那你再看看5版本的:https://www.virtualbox.org/wiki/Download_Old_Builds

回答于 2020-03-26 13:19

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利用FileZIlla上传转录组数据到GEO,为什么用电脑默认的ip地址没...

上传数据可观看课程:NCBI数据上传

回答于 2020-03-26 13:17

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老师您好!用SNPhylo构建系统进化树,该如何输入input file?

这个建议阅读 SNPhylo软件的使用说明文档:http://chibba.pgml.uga.edu/snphylo/  介绍的很详细;

回答于 2020-03-26 13:16

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知道序列,怎么确定它是我们要研究的特定那个基因成员啊,求解

可以使用pfam,SMART,CDD等提交序列查询: PFAM :https://www.omicsclass.com/article/877 CDD:https://www.omicsclass.com/article/310 SMART https://www.omicsclass.com/article/681

回答于 2020-03-26 13:14

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老师您好,我用MEGA7.0做系统进化树的时候,基因ID中有分号,但...

把分号删除重新构建进化树

回答于 2020-03-26 13:12

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Linux系统中在删除GFF文件ID中不必要信息,如gene:时出现报错

可以不加  -i 修改文件; 或者用notepad++ 搜索替换

回答于 2020-03-25 20:29

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MCScanX报错

检查文件路径是否正确

回答于 2020-03-25 20:28

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请问老师,这个报错是为什么啊

检查文件路径是否都正确

回答于 2020-03-25 20:28

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老师从gff文件中用mRNAID_to_geneid.pl提取gene和mRNA之间的对应...

输入文件是不是GFF格式的检查一下; 可以把代码贴一下,不然不好分析原因;

回答于 2020-03-25 20:27