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4092 个回答

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关于用Perl脚本进行同源基因正选择分析

软件安装问题 建议使用docker :  https://www.omicsclass.com/article/1181 

回答于 2021-10-21 17:13

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生存分析:老师,我看到了这个生存分析的代码在利用索引定义一个...

定义之后再修改里面的数据吧,方便操作;

回答于 2021-10-21 13:59

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筛选差异分析基因的时候上调下调基因数量差别太大正常吗?

有可能的,正常的,

回答于 2021-10-20 09:41

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老师您好,学生出现了和您一样的问题,wgcna模块是一个颜色,特...

可能是样本数量太少导致的,WGCNA分析样本数量至少20个以上吧

回答于 2021-10-15 13:25

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您好,qtlseq可以运行,麻烦看一下结果,阈值为什么都不是线而是点

SNP太稀少了吧,平滑的时候导致线断了。  建议用重测序的数据,转录组的数据SNP稀少结果不好。 基因组比较大,窗口调大些试试吧

回答于 2021-10-15 13:24

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使用tcga_gene_exp_download.r下载TCGA数据始终无法产生gene exp...

运行的过程中报什么错了了,可以截图一下吗? 再个,这个脚本会整理数据,电脑的内存太少会导致内存不够,从而运行失败; 建议最低 至少16G以上  32G为佳

回答于 2021-10-15 09:08

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请问,有没有转录组分析的课程?

转录组相关课程: 有参转录组结果解读 https://bdtcd.xetslk.com/s/9R73j 无参参转录组结果解读 https://bdtcd.xetslk.com/s/1TmM7v 转录组数据挖掘 https://bdtcd.xetslk.com/s/2Jwe0Z 转录组数据自主分析: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2021-10-14 14:53

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如何添加内参物种构建进化树

那就找到NCBI上找相应基因组的数据,别人发基因组了,肯定有重测序数据;

回答于 2021-10-14 11:46

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荧光定量验证转录组结果该怎么看?

那就换其他的基因做,找到有差异的基因

回答于 2021-10-14 11:44

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老师您好!我想做的物种只能找到fna文件和gbff文件(已经确认只...

NCBI上的 数据不标准,直接做基因家族分析会报错: 最简单的方法,你找下基因组的作者,然后问他要一下gff文件。一般情况下,有基因组就有文章,你找到文章,然后给作者写信要就可以了。

回答于 2021-10-14 11:43