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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4108 个回答

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老师,请问在进行共线性分析时,出现ValueError: A total of 0 a...

输入文件 bed文件和cds文件里面的基因ID是否对应,检查一下;

回答于 2021-11-10 09:54

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老师,我利用linux运行mcscanx时一直提示以下错误,怎么解决啊?

输入文件路径写错了你检查一下:

回答于 2021-11-10 09:50

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无法下载TCGA数据,怎么弄

看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/4237

回答于 2021-11-09 10:24

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TCGA用R数据下载错误

文件输出路径没有设置正确,你可以把这个变量打印出来看一下,看看这个路径在你的电脑里面是否存在

回答于 2021-11-09 10:23

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如何判断片段复制?

你可以根据定义自己判断一下:https://www.omicsclass.com/question/1 

回答于 2021-11-08 10:20

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NCBI fasta格式文件的模板

fasta格式说明见:https://zh.wikipedia.org/wiki/FASTA%E6%A0%BC%E5%BC%8F 

回答于 2021-11-08 10:19

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如果已知数据没有转录组数据,可以用同属不同种植物转录组代替吗...

不可以用同属的,必须是相同物种的;你再找找数据吧

回答于 2021-11-08 10:17

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基因组gff3文件中mran parentID与gene ID不对应,应该怎么做?

ID 对应是说 GFF里面的mRNA ID与蛋白序列的ID,不是你说的这个,你这个GFF文件没问题的;再看看视频课程里面的讲解: https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-11-05 10:07

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老师,您有没有mcscanx的压缩包文件啊,我网站打不开

打不开 可以咨询网站作者,我这里也不清除; 如果想用mcscanX  可以用我们基因家族的docker镜像,里面安装了这个软件: docker 安装使用教程: https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2021-11-05 09:46

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老师 问一下 我这是pep蛋白文件 但这个文件开头用的不是转录...

这个需要手动写代码修改

回答于 2021-11-04 11:07