omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师您好，我在使用组学大讲堂docker镜像进行转录组分析时遇到问...

可能有些基因没有转录本ID，你看看数据对应的行GFF是不是有异常；修正或者删除

回答于 2022-10-07 19:03

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对的，真菌是ITS区，不同物种保守性差，一般不做进化树；你再看看课程吧，里面有讲的

回答于 2022-10-07 19:01

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这时样本OTU总丰度波动范围从2w到6w。这里有问题；抽平之后，每个样本里面的OTU总丰度应该是一样的；你再确认一下华大是否抽平

回答于 2022-10-07 19:00

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hmm文件有问题，不知道你怎么建立的，建立错了

回答于 2022-10-05 20:01

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内存不够，升级电脑内存或者多给docker内存；https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2022-10-05 11:29

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这个没有定论，我们一般不删除的；每个人分析的目的不一样，我不知道你的分析目的不好给建议

回答于 2022-10-05 11:26

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截图不全，看不到你的命令，可能命令行有问题吧， ITS无法运行进化树

回答于 2022-10-04 08:08

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population_structure.txt 这个文件的样本数量，和其他文件的样本数量不是一样的吧，你检查一下；

回答于 2022-10-04 08:07

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文件路径设置错误的，程序找不到文件l 不会用变量就直接使用文件在docker里面的绝对路径

回答于 2022-10-04 08:04

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total显示为0 ，这个不用解决，忽略就行

回答于 2022-10-04 08:03