omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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群体遗传课程admixture的问题

看看内存是否足够，内存不够也会报错：https://www.omicsclass.com/article/1413 或者换个电脑试试，Windows电脑有时候会有兼容问题；不用自己安装软件，用群体遗传进化镜像里面的软件即可；

回答于 2023-09-12 09:24

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基因组索引建立没有成功，或者索引文件路径写错了，你检查检查的；另外，hisat建立索引需要的运行内存很大，可能导致索引建立失败；

回答于 2023-09-12 09:22

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docker小鲸鱼后台打开了吗？你看看的

回答于 2023-09-10 13:43

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可能数据库更新了，正常的现象；

回答于 2023-09-10 08:47

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不同的种加些不同的前缀就可以：

回答于 2023-09-10 08:45

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这里有官方网站可以下载：https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/

回答于 2023-09-10 08:44

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看看这个：https://www.omicsclass.com/article/1266

回答于 2023-09-10 08:42

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使用经过过滤的cleanvcf文件，SNP和indel都可以做gwas，indel做GWAS需要单独格式转换，因此我们一般去除INDEL只用SNP做GWAS分析；

回答于 2023-09-10 08:41

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可能哪里出错了，你需要检查一下，有没有报错信息，我这才好给你分析原因

回答于 2023-09-10 08:39

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这个文件是镜像里面的，你学习课程在对应的docker镜像里面，也可以到官方下载：这里有官方网站可以下载：https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/

回答于 2023-09-09 10:08