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5 如何从CAFE结果中提取扩张（或收缩）的基因家族

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3 共线性分析做组间时，anchors文件只有以下内容，进行后续筛选和绘图时，报错为“need more values to unpack"，请问是何种状况？mcscanx分析有物种和同源性要求吗？

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5 基因id与cds id不一致，无法提取cds序列怎么办

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5 MCScan(jcvi) 生成anchors文件大小为怎么办？？？

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5 转录调控子（transcriptional regulator）和转录因子（transcriptional factor）什么区别？

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5 如何对比判断一个物种两个基因组质量的好坏？

  • 2020-05-26 18:14
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5 构建系统进化树时利用课程提供的脚本提取不出来cds序列是为何？

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5 老师，您好，学习咱们得基因家族分析课程。按照咱们得代码运行，发现第二次搜索hmmsearch，发现输出空吧，我把以前生成的文件和你们提供的demo比了一下都一样，可是WRKY_domain_new_out.txt空白

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10 NCBI序列上传

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5 bootstrap consensus tree导出nwk文件格式时Branch_lengths选项无法选择

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20 NCBI的数据库更新了，两份数据文件用哪个？

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10 请问大神们同一“目”（Order，分类学定义）下物种的基因组相似性大不大，想做比较基因组。

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5 假基因预测问题

  • 2020-04-08 20:35
2 解决

5 请问是不是只有正链的顺式作用元件才调控基因表达

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10 关于小麦基因家族中的同源性问题

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10 如何根据注释文件信息，提取并计算基因组相应区域（如CDS，exon，intron）区域的长度？

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10 snpEFF生成的txt文件每一列数值的含义

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5 如果物种基因组较小，所鉴定的基因家族基因很少，只有几个，这种情况怎么处理才能顺利的发文章？

  • 2019-06-21 14:00
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5 Mac系统的共享文件后为什么不能hmmsearch（是共享文件的原因吗）,相同的操作在win上没问题？

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5 生成MCScanX的gff文件时发现蛋白序列id是cds序列的id，请问怎么转成mRNA或者geneID