上面已经提示了,基因的ID,也就是simple里面的基因ID 在bed里面找不到,你确认是不是搞错了; 关于多个基因组放在一起绘制共线性,你可以参考这里:MCscan GitHub wiki https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version) , GitHub, June 9th, 2018
回答于 2019-06-28 16:36
cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了: 批量比对计算参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939 课程已经更新了这个内容;https://bdtcd.xet.tech/s/1BAqPp
回答于 2019-06-26 11:18
刚刚试了下网站是可以打开的,http://gsds.cbi.pku.edu.cn/ 如果长时间打不开可以参考这里: 可以参考这里搭建一个本地GSDS网站,就不会打不开了:https://www.omicsclass.com/article/1308
回答于 2019-06-23 19:27