非模式的动植物可以通过同源比对,相似的基因具有相似的功能,可以那基因的cds序列或者蛋白质序列比对一些公共数据库比如 NR,NT,GO,pfam,swissport等数据库,然后得到基因的注释信息。
回答于 2019-07-12 16:09
你的GFF文件可能不是标准的gff文件,你截图看看; 类似问题:https://www.omicsclass.com/article/816
回答于 2019-07-10 17:18
网页编辑肯能不稳定,你可以下载svg或者PDF格式的图片用 Adobe iillustrator 软件编辑;
回答于 2019-07-08 10:48
注释一般都是同源比对,相似的基因有相似的功能,咱们研究的基因如果比对到数据库某个基因就认为我们的基因也具有相同的功能; 所以不同的数据库收录的库序列不一样,注释会有差异也是正常的;建议取并集看看注释结果;
回答于 2019-07-03 17:41
提示没有primary.site 参数,你不能随意添加参数; 更多TCGA数据下载的参数可以参照官方说明:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/inst/doc/download_prepare.html
回答于 2019-07-02 10:21
存放的路径中有个目录名字有空格: 简单的处理,把aspera 存储到没有空格目录的路径;或者把路径用"" 号引起来 关于aspera上传数据可以参考:https://www.omicsclass.com/article/398
回答于 2019-06-30 16:41