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老师，MEGA画完树后出图PDF，但是获得不了完整的图，PDF只有四分...
建议导出nwk文件格式的tree文件，然后用evolview网站美化进化树：https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-06-03 11:20
RNA-seq的转录水平表达分析HISAT, StringTie and Ballgown 中R语...
fold changes only available for 2-group comparisons 只能两两比较，你可能输入的分组信息有三组，你检查一下；bg_chrX_filt这个数据里面分组列orgnization里面是不是两个水平； R 语言不懂可以学习： R语言快速入门与提高 R语言画图、
回答于 2019-05-29 18:07
pfamscan的translate选项应该怎么使用
translate命令应该添加到环境变量PATH当中；这个命令应该是在安装hmmer的时候有的： 这个命令应该在hmmer较早的版本中有hmmer-2.3.2，最新版本好像没有，你对应安装一下这个hmmer，然后把路径添加到环境变量中就可以；：
回答于 2019-05-28 18:02
Blast2go本地化过程中，运行官方文件b2g4pipe_v2.5.zip中“runPip...
blast2GO 本地安装比较麻烦，还涉及mysql数据库设置，出现错误也是很复杂，光看错误不好知道原因，建议先谷歌搜索一下吧；
回答于 2019-05-28 11:34
perl脚本去除fa文件中ID重复的序列
脚本语法有错误吧，你了解一下perl的语法，张贴可能哪里漏掉了； 最好用editplus等专业的文本编辑器编辑perl脚本语言，不要用windows自带的记事本；
回答于 2019-05-28 11:32
blast2go注释，报错“Exception in thread "main" java.lang.NoCl...
我用的blast2go v2.5 ：输入的是blast的xml文件，你可以参考一下： java -XX:ParallelGCThreads=5 -cp /share/work/biosoft/blast2go/v2.5/*:/share/work/biosoft/blast2go/v2.5/ext/*: es.blast2go.prog.B2GAnnotPipe -in /share/work/database/ref/Lactobacillus_plantarum/NCBI/WCFS1/ann/Nr_Dir/Gene_longest_trans_c...
回答于 2019-05-28 11:29
老师你好，我想问一下，我想用其他物种的一条蛋白质序列搜索小麦...
可以使用blast比对：https://www.omicsclass.com/article/269
回答于 2019-05-24 17:05