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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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R语言中Venn图绘制,安装vennerable包时出现以下问题,寻求老师...

试试用这个代码安装: install.packages("Vennerable", repos="http://R-Forge.R-project.org") 安装过程如下,这里有几个依赖包,dependencies ‘graph’, ‘RBGL’, ‘reshape’ are not available  报错,单独安装一下。再安装这个Vennerable包就好了 Type 'q()' to quit R.> local({r <- getOption("repos") + r["...

回答于 2019-07-31 10:16

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老师,我按照您的方式把序列路径也填上了,可还是没读进去,帮忙...

试试路径里面不要有中文,可能clustalw对中文支持不好。

回答于 2019-07-30 08:55

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请老师帮忙看看为啥一样的操作,将anchors.simple更新了基因家族...

layout文件最后不要有多余的空行,看看这个:https://www.omicsclass.com/article/571

回答于 2019-07-30 08:54

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通过转录组筛选出的基因如何设计定量pcr的引物,谢谢!

找到基因对应的cds序列用DNAman等软件设计引物就好了;

回答于 2019-07-29 17:12

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eclipse当中R插件StatET安装遇到的问题

初学者不建议用eclipse中的statET插件编写R脚本语言,建议使用Rstudio编写测试R代码会更好。

回答于 2019-07-29 13:52

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构建进化树

有些序列差异太大,建议删除些gap再构建进化树,或者直接用基因的结构域序列构建进化树;

回答于 2019-07-29 13:50

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请问老师,精细定位出来的一个区间如何进行基因注释啊,

找到对应区间里面的基因,然后blast同源比对nr或者nt库注释看看基因功能。

回答于 2019-07-29 12:42

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基因家族分析

建议读读其他物种中分析这个家族的参考文献,看看别人怎么命名你这个家族;

回答于 2019-07-29 10:25

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Java环境变量配置的问题

引号去掉试试: 详细java环境配置:https://www.omicsclass.com/article/298

回答于 2019-07-29 10:15

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用网站确认结构域的时候,SMART网站没有,但CDD和PFAM都有,要舍...

你具体看看结构域序列是否是你要的结构域,是的话建议保留;

回答于 2019-07-29 10:12