遇到这个问题,应该首先检查文件路径是否写错,文件格式总染色体基因ID是否统一; 如果以上检查都没有问题:可能是windows和linux系统编码的问题导致的,在linux中换行符一般是\n 而在windows中是\r 因此为了统一,应该统一编码UTF-8 千万不要用记事本:https://www.omicsclass.com/article/395 或者查看一下,gff文件...
回答于 2019-09-06 18:29
看代码应该是group有问题,至少应该有两个分组水平才行,你看看group里面是不是全部一样?如果是全部一样说明没有分组; 代码中文乱码建议设置一下:https://www.omicsclass.com/article/294 R语言及基础不好建议学习:R语言快速入门与提高
回答于 2019-09-06 09:45
blastall是早期blast版本里面才有,建议安装blast-2.2.26 以前的版本;
回答于 2019-09-05 14:49
NCBI中CDD可以查看保守结构域:https://www.omicsclass.com/article/310 可以下载信息,找到对应的序列看看完整与否; 关键是你自己要对自己研究的基因家族非常了解,建议多看看文献;
回答于 2019-09-05 14:47
这个和基因结构与染色体位置分析没有关系,你直接做就可以了; 更多基因家族分析可以观看视频教学:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-09-05 14:41
不知道你的基因家族共线性怎么跑出来的? 全基因组共线性又是用什么方法得到的? 如果两种不同的方法出现差异,可能某些参数设置有差异导致,属正常现象,以一种方法为准就行;
回答于 2019-09-04 15:35
都已经提示了 最后的输出目录不对,你检查当前目录下有SNP目录吗? linux基础不好建议学习:linux系统使用
回答于 2019-09-04 09:21
结果应该在et这个变量里面,至于谁是对照不重要,最后看看结果表达量就知道了; R语言基础不好可以学习:R语言画图、R语言快速入门与提高
回答于 2019-09-04 09:18