omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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你好，我遇到了和你一样的问题，Circos could not find the conf... 已采纳

路径写错了，差一个根目录： linux基础不好建议学习：linux系统使用

回答于 2019-12-11 09:36

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可以看看这个，染色体有问题：https://www.omicsclass.com/article/572 检查所有文件里面的染色体ID是否一致：https://www.omicsclass.com/question/1605

回答于 2019-12-10 15:52

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上面已经有提示，你看看哪个基因是否缺少东西，检查一下

回答于 2019-12-10 15:44

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物种基因组注释不好的话，有可能比对率较低。再有检查一下建立的参考基因组索引是否正确，基因数量是否全。

回答于 2019-12-10 14:41

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具体热图绘制网站见：https://www.omicsclass.com/article/792

回答于 2019-12-10 14:18

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可以换个hmm文件再搜索一次，得到的hmmer结果文件里面的基因取下交集就可以了；

回答于 2019-12-10 14:17

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这个分化时间，可以用kaks分析估算得到，基因家族分析课程里面有涉及这部分内容：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-12-10 14:16

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可以到NCBI数据库中搜索功能关键字，查找相关基因。

回答于 2019-12-10 14:15

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检查文件： 1.检查所有输入文件的路径是否写正确； 2.检查一下所有文件的内容是否正确，因为涉及到了很多文件，文件之间的ID要对应，如基因ID，染色体ID等等，看看是不是有问题漏改了一些信息；

回答于 2019-12-06 19:22

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建议检查一下那个基因结构域所在的序列，太短说明结构域序列不完整，你可以多截取一些序列仔细查看一下这个基因。

回答于 2019-12-05 09:51