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想请教老师热图里的Row-z-score和Column-z-score分别是如何计算...

一般安装行标准化,这个基因在不同的样品中的表达量高低更加明显,使绘图结果更明显;

回答于 2019-11-28 22:37

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删除哪个?

建议删除:gene:   CDS:  mRNA: ncRNA:   exon:

回答于 2019-11-28 22:36

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老师好!我的物种基因注释水平在scaffold,之前课程里面的思路和...

遇到需要染色体的部分分析不了,比如共线性分析; 其他都可以做的;

回答于 2019-11-28 22:35

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我在构建进化树的时候,分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特...

分组这个需要调整,你再琢磨琢磨。看看基因序列特点。

回答于 2019-11-28 22:33

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MEGA7.0

可能你那里点错了吧,应该是有的;

回答于 2019-11-28 22:32

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求救 为什么我删掉:前的为了与蛋白一致,可不显示转录本信息呢...

你的转录本ID与基因ID一样,不影响的;

回答于 2019-11-28 22:31

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发现一个基因通过domain_xulie.pl提取的位置与SMART鉴定时的doma...

你查看一下具体的结构域是否完整,详细了解自己的基因家族结构域特点,可适当调整位置再截取;

回答于 2019-11-27 13:17

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RNA-seq分析建立基因组index遇到问题

你说的硬盘,和内存没有关系;  hisat建立索引需要很多内存,报错信息也说明内存不够; 建立人类基因组索引3G,大概需要150G的内存,你看看你的应该增加物理内存;虚拟机做转录组分析比较困难。

回答于 2019-11-27 13:15

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MCScanX共线性分析出错,请问如何解决?

文件没有找到,命令行没有写完整吧,缺少文件,你检查一下;

回答于 2019-11-27 13:14

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启动子分析,使用get_promoter.pl提取上游序列时发生如下报错(...

是文件不存在的意思,你再看看英文意思: 标红的文件路径不对:

回答于 2019-11-26 17:33