可以看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/805
回答于 2020-06-04 17:11
NCBI上的基因组数据,有的整理的不好,建议到其他网站下载;或者有作者信息,联系作者单独发给你;
回答于 2020-06-04 14:02
用更好的工具docker:https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink 省去安装软件的麻烦 可解决软件安装问题,以及共享文件夹问题
回答于 2020-06-04 14:01
使用我们组学大讲堂提供的biolinux,里面又安装好的meme软件:https://www.omicsclass.com/article/526 或者用我们组学大讲堂提供的gene-family docker镜像: 用更好的工具docker:https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink 可解决软件安装问题,以及共享文件夹问题
回答于 2020-06-04 13:59
可能网址弄错了吧,或者网络的原因。 我们现在不怎么用biolinux虚拟机,用更好的工具docker; 最近有个数据下载课程,可以看一下:
回答于 2020-06-03 09:41
当然可以的,做的多了可以做成数据库,发高分文章,例如这篇转录因子基因家族分析,很多家族很多物种,发表在NAR上:http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/index.php
回答于 2020-06-02 15:56
当然可以的,做的多了可以做成数据库,发高分文章,例如这篇转录因子基因家族分析,很多家族很多物种,发表在NAR上:http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/index.php
回答于 2020-06-02 15:53
文件格式有问题吧,你的bed文件才14行,有问题吧 如果基因这么少,没必要用mcscan比较基因组分析了;做个blast就好了
回答于 2020-06-01 11:34