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sra文件转换为fastq文件
sra数据NCBI提供工具sratoolkit可以转换：https://www.omicsclass.com/article/932 我们近期有课程，你可以关注公众号有通知：
回答于 2020-05-28 09:37
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gff文件包含gene,cds,exon,mRNA的信息，请问如何获取intron的位...
GFF里面有外显子的信息，你看懂了GFF文件，再学习一下perl或者python就可以完成： 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通
回答于 2020-05-26 13:15
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stringtie报错
可能是软件安装的问题吧，转录组如果不关注新基因，没必要做转录本组装， 建议学习docker 软件安装问题很好解决：用更好的工具docker：https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink 学习转录组数据分析课程：二代测序转录组数据自主分析、
回答于 2020-05-26 13:11
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get_promoter.pl 的报错
代码是不是改动过，索引报错了， 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通
回答于 2020-05-26 13:06
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提取基因在染色体位置时发现gff3文件中的染色体编号不好理解。疑...
哪些不是数字的染色体编号应该的scffold，你再了解一下你的物种基因组情况，看看发布这篇基因组的文章就知道了；
回答于 2020-05-22 10:10