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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4091 个回答

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老师,想请教一下,如果这两个地方都写了是不是重复设置了,写了...

写的哪个?  相关性吗? 不同的相关性算法 不重复的;

回答于 2020-05-22 10:09

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docker镜像

自己创建镜像并安装软件见:https://www.omicsclass.com/article/1181 不建议初学者自己创建镜像和安装软件; docker hub上已经有很多别人安装好某个软件的镜像,你docker search 搜索一下,重新下载一个新的镜像就行;

回答于 2020-05-22 10:08

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MCScanX中的layout 文件的y列

对的y轴是按比例分配的,范围0-1。你可以把图片的大小修改一下,高度调大些试试:--figsize  python -m jcvi.graphics.karyotype  --format=pdf  --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout

回答于 2020-05-22 10:05

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求助,在docker内使用treemix镜像,引用一个.sh命令时报错

刚刚搜索了了一下treemix镜像是有的额,但是不是我们提供的镜像,你需要取了解一下镜像的使用,已经treemix的使用; $ docker search treemixNAME                DESCRIPTION         STARS               OFFICIAL            AUTOMATEDcalkan/treemix                          0$ docker pull calkan/treemix

回答于 2020-05-21 18:16

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进化关系分析 老师你好!我想看看这几个bhlh基因中的哪个和sa6G5...

原因不太清除,你再查查的,我分析是因为进化树不仅仅考虑序列的相似性,还考虑其他的原因

回答于 2020-05-20 10:47

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找不到kaks分析的文件

请使用我们组学大讲堂提供的biolinux里面安装了这些软件:https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2020-05-20 10:46

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在用tbtools做进化树+motif+结构图,出现这样的错误

三个文件里面的ID修改要一一对应,你再检查一下吧

回答于 2020-05-20 10:44

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用MCScanX分析没有得到tandem文件

blast正常运行结束了吗?中通是不是断了。 如果一切正常,那你这个可能就没有共线性;

回答于 2020-05-20 10:43

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老师您好我用咱们线下课程的代码做WGCNA,和样品数据相比,我自...

把运行的代码贴一下,还有输入文件贴一下,我才好分析原因,你这样我只能猜测了 ; 代码应该没问题,只是输入数据不一样打印的问题把,你继续往下运行吧

回答于 2020-05-20 10:41

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老师! 我想要以拟南芥中对应的同源基因对目标物种BHLH基因家族...

你说的是下面箭头处的两个不知道怎么选吗? 我猜是拟南芥相同基因不同的转录本吧,你到GFF基因注释文件里面看看他们的关系就好了,没必要选择,他们是同一个基因; https://www.omicsclass.com/question/2800

回答于 2020-05-19 12:36