omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14486金币数
81910 经验值
447个粉丝
主页被访问 89557 次

4110 个回答

0 赞同

MEME就运行脚本的时候,其中的maxsize 指最大输入文件的字符数,...

 -minw 6 -maxw 100  这个两个参数设置motif的长度范围单位时bp,  这个长度范围可长可短,得根据家族特点进行设置,建议看文献设置参数;这个参数适合大多数基因家族;  -time 18000 -maxsize 6000000  这个两个参数一般不用改,如果报错了,显示时间,或者file size 大小报错,可以把这个两个参数调大,本身这个参数已...

回答于 2021-01-28 16:57

0 赞同

假基因预测问题

假基因预测可以看看这个:https://www.doc88.com/p-3718098142721.html 没有预测过假基因,你再看看文章的查查资料;

回答于 2021-01-28 11:45

0 赞同

能否通过某种软件预测真基因和假基因

假基因预测可以看看这篇文章:https://www.doc88.com/p-3718098142721.html

回答于 2021-01-28 11:43

0 赞同

安捷伦双色通道:探针表达值是什么?log2(R/G)还是 log2(G/R...

处理样本一般标红色荧光cy5 (R) ,对照样本标绿色荧光cy3 (G), 两个比值 你自己看想用哪个用那个,这些样本信息文字要看看: log2(R/G)  这个比值就是差异比较结果

回答于 2021-01-26 15:15

0 赞同

docker Hub中的bio-linux镜像和 gene family 镜像有什么区别

做基因家族分析  建议使用: gene family   镜像,里面软件都有安装; 学习linux课程可以使用biolinux docker镜像;

回答于 2021-01-26 13:26

0 赞同

老师您好,我在做mcscanx共线性分析基因家族加倍实操课程时,安...

看报错 系统缺少java吧

回答于 2021-01-25 10:36

0 赞同

安捷伦双色通道 “RawData=read.maimages(files=files,source="ge...

你把你的代码  贴全一些,不然不好分析原因。  

回答于 2021-01-25 10:33

0 赞同

请问在进化树+基因结构+motif+domain的四联图中,为什么domain结...

看看这个文章有详细方法:https://www.omicsclass.com/article/624 检查不同文件之间的ID是不是一样,要保持一样

回答于 2021-01-21 13:54

0 赞同

基因家族结构域及基因家族长度问题

忽略C 就当他不存在,这和序列长度没关系的;长度不会发生变化;

回答于 2021-01-21 13:54

0 赞同

请问MEME软件如何确定motif个数??应该设置几个呢?查文献查不...

一般设置 10个或者20个

回答于 2021-01-21 10:22