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请问老师,GEO数据分析时,GPL平台没有Annotation SOFT table文...

没有注释文件,该数据无法分析

回答于 2021-02-05 10:19

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请问老师,GEO数据分析时,运行gset = getGEO(GSE, GSEMatrix =T...

可能是网络问题,网速不好可能中断,你可以重新反复运行下载的这个代码,直到下载完成; 也可换个网速快的网络环境再试试; 

回答于 2021-02-05 10:18

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因为现在安装的blast+的版本太高,所以里面没有blastall这个,那...

blast+的用法见这里:https://www.omicsclass.com/article/269

回答于 2021-02-05 10:16

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我在做MCScanX做共线性分析的时候,提取蛋白的文件,出现下面的...

提示的不是有误,是你的输入文件路径写错了,没有找到文件,你再看看输入文件路径是否写错;

回答于 2021-02-05 10:16

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如何安装bioperl?

你可以学习linux系统这么课,里面有各种软件安装教程:https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ perl安装bioperl包参考:https://github.com/bioperl/bioperl-live/blob/master/README.md

回答于 2021-01-30 10:23

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MEME就运行脚本的时候,其中的maxsize 指最大输入文件的字符数,...

 -minw 6 -maxw 100  这个两个参数设置motif的长度范围单位时bp,  这个长度范围可长可短,得根据家族特点进行设置,建议看文献设置参数;这个参数适合大多数基因家族;  -time 18000 -maxsize 6000000  这个两个参数一般不用改,如果报错了,显示时间,或者file size 大小报错,可以把这个两个参数调大,本身这个参数已...

回答于 2021-01-28 16:57

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假基因预测问题

假基因预测可以看看这个:https://www.doc88.com/p-3718098142721.html 没有预测过假基因,你再看看文章的查查资料;

回答于 2021-01-28 11:45

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能否通过某种软件预测真基因和假基因

假基因预测可以看看这篇文章:https://www.doc88.com/p-3718098142721.html

回答于 2021-01-28 11:43

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安捷伦双色通道:探针表达值是什么?log2(R/G)还是 log2(G/R...

处理样本一般标红色荧光cy5 (R) ,对照样本标绿色荧光cy3 (G), 两个比值 你自己看想用哪个用那个,这些样本信息文字要看看: log2(R/G)  这个比值就是差异比较结果

回答于 2021-01-26 15:15

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docker Hub中的bio-linux镜像和 gene family 镜像有什么区别

做基因家族分析  建议使用: gene family   镜像,里面软件都有安装; 学习linux课程可以使用biolinux docker镜像;

回答于 2021-01-26 13:26