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QTL-seq数据分析实操课程中命令中用到的qtlplot,如果不使用dock...

原版这里有:https://github.com/YuSugihara/QTL-seq 但是组学大讲堂提供的做过修改:https://github.com/omicsclass/QTL-seq

回答于 2021-02-22 10:55

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基因家族鉴定

你都没说你分析得是哪个家族,我也不知道你的家族亚组怎么分?建议你在读读文献多多了解自己的家族自然就会分析了;  不同数据库确认结构域,建议取并集,有些数据库更新比较慢结果有差异是正常的;

回答于 2021-02-22 10:47

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老师您好,请问,我本来有11个样本,按课程里面的代码输入后,为...

我数了是11列样本: 你的数据里面没有 ID和gene symbol 这个出错了吧

回答于 2021-02-22 10:45

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在QTL-seq分析的时候的vcf文件中双亲在后面,而子代双池在前面,...

如果用的是组学大讲堂提供的docker镜像就不需要更改,只是命令行参数样本名字写对就可以,因为我们对qtlseq这个python脚本做过修改; 但是,你自己安装的软件就按照软件说明使用。

回答于 2021-02-22 10:40

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motif 出现以下状况 是不是应减少motif个数 尤其是字母都齐...

后面的motif只在两个基因中出现,你可以把motif的长度范围设置大一些看看能不能再找到更多的motif

回答于 2021-02-19 16:03

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老师您好,我在进行富集分析时,读取文件中的GeneID出现如下报错...

你检查你的基因ID是不是entrzID,不是的话需要转换一下

回答于 2021-02-18 15:44

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基因家族分析

不知道你怎么搜索的,一半也不一定错误吧

回答于 2021-02-16 16:05

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gvcf转vcf

上一步生成gvcf有问题吧,

回答于 2021-02-16 16:04

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虚拟机之前一直正常,刚刚卡了,关机后再打开就是这个样子,请问...

重启试试,再不行 重新安装

回答于 2021-02-16 16:03

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No such file or directory at script/get_fa_by_id.pl line 23....

输入文件路径或者文件名字写错了,你仔细检查命令行

回答于 2021-02-16 16:03