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安装qtlseq后,运行程序出现ModuleNotFoundError: No module nam...

python 的numpy包安装一下吧; 基础不好按照我们的课程来吧,你这样很费劲的;  生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

回答于 2021-02-22 18:00

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老师,从原版上或者你的改进版上下载或者安装qtlseq的时候,用co...

conda安装的是  原始版本;不是我们的版本,我们的版本需要下载手动安装; 

回答于 2021-02-22 17:28

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请问怎么确定突变速率r呢?

突变速率不同的物种是不一样的,一般是通过查阅相关文献获得:https://www.omicsclass.com/question/896

回答于 2021-02-22 11:49

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黄老师,用的你在github上的qtlseq,运用原始数据,从cleanreads...

你的系统有些软件没有安装, 建议学习我们的重测序课程,里面有变异检测分析课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ

回答于 2021-02-22 11:47

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老师您好,我在进行GEO数据差异分析时,出现如下报错,请问我该...

建议你看看 group这个变量和exp的列名是否有交集,自己检查数据; R语言基础:https://bdtcd.xetslk.com/s/2G8tHr

回答于 2021-02-22 10:57

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QTL-seq数据分析实操课程中命令中用到的qtlplot,如果不使用dock...

原版这里有:https://github.com/YuSugihara/QTL-seq 但是组学大讲堂提供的做过修改:https://github.com/omicsclass/QTL-seq

回答于 2021-02-22 10:55

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基因家族鉴定

你都没说你分析得是哪个家族,我也不知道你的家族亚组怎么分?建议你在读读文献多多了解自己的家族自然就会分析了;  不同数据库确认结构域,建议取并集,有些数据库更新比较慢结果有差异是正常的;

回答于 2021-02-22 10:47

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老师您好,请问,我本来有11个样本,按课程里面的代码输入后,为...

我数了是11列样本: 你的数据里面没有 ID和gene symbol 这个出错了吧

回答于 2021-02-22 10:45

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在QTL-seq分析的时候的vcf文件中双亲在后面,而子代双池在前面,...

如果用的是组学大讲堂提供的docker镜像就不需要更改,只是命令行参数样本名字写对就可以,因为我们对qtlseq这个python脚本做过修改; 但是,你自己安装的软件就按照软件说明使用。

回答于 2021-02-22 10:40

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motif 出现以下状况 是不是应减少motif个数 尤其是字母都齐...

后面的motif只在两个基因中出现,你可以把motif的长度范围设置大一些看看能不能再找到更多的motif

回答于 2021-02-19 16:03