omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14518金币数
82130 经验值
448个粉丝
主页被访问 91774 次

4124 个回答

0 赞同

GWAS做关联区域分析时,根据p值获取关联区域中,为什么要用如下...

bedtools merge 加上P值是因为,上一步flank 取的是p值两边的region,如果不加pvalue.bed 会出现空档: https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/tools/merge.html

回答于 2025-03-14 08:35

0 赞同

我在win11本地GWAS分析时,进行plink。结果报错了(Segmentation...

看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1891

回答于 2025-03-14 08:32

0 赞同

请问老师。镜像启动是哪里出错了

后台没有这个镜像吧,你docker images 查看一下后台镜像 docker images

回答于 2025-03-12 09:16

0 赞同

cellchat的netVisual_bubble

刚刚测试了一下,可能是cellchat的bug,可以换成细胞类型序号绘制这个图,下面的代码获得细胞序号: print("设置感兴趣的细胞类型对应的细胞序号")print(paste(1:length(levels( cellchat@idents )),levels( cellchat@idents ),sep=":")) #单独的 print(paste(1:length(levels( cellchat2@idents$joint )),levels( cellcha...

回答于 2025-03-10 10:56

0 赞同

老师 请问这个运行时需要很久吗,上面显示的需要7天

这个库在我吗云服务器上已经有了,不需要下载:/share/database/eggNOG/emapperdb-5.0.2/

回答于 2025-03-09 07:47

0 赞同

老师,想问一下meme.html怎么在网页中打开呢?

filezllia下载下来打开,或者用rstudio-server在线打开;

回答于 2025-03-06 10:56

0 赞同

老师,我运行这条命令报错了,请问哪里出问题了 ,感谢老师

命令行中的引号要用英文书法下输入,你改下

回答于 2025-03-05 18:48

0 赞同

怎么从泛基因组call SNP呢?

这个课程里面有讲的:https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9

回答于 2025-03-05 18:47

0 赞同

重测序分析

这个地方需要改一下,你的染色体编号有4吗?  -L 也后面可以跟一个文件,里面一条染色体一行:  chr.list

回答于 2025-03-05 12:16

0 赞同

你好,我也遇到了一样的问题:docker里omicsclass的镜像都搜索不...

dockerhub 国内上不了,有购买我们课程可以联系客服处理:点击联系客服

回答于 2025-03-03 09:31