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4124 个回答

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在JGI上下载gff文件和fa.gz文件有问题,感谢答疑

这里提示文件格式不对,你下载的数据是不是解压过,解压了,就不要加gz后缀了:

回答于 2025-04-02 09:02

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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错

core dumped 可能是电脑系统软件编译问题,导致运行不了,建议换个电脑试试的; 或者到我们云服务器上分析数据;

回答于 2025-03-31 17:28

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从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻...

只是 警告信息,忽略就行,耐心等待程序运行完成;

回答于 2025-03-28 17:17

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从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻...

已经生成GFF了,不知道你说的报错指的是什么?

回答于 2025-03-28 13:39

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老师,别人发的一篇泛基因组文章,应该是从头组装构建的,每个基...

可行的,但是操作起来比较麻烦。建议自己从头构建吧 泛基因组构建有课程见:https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9

回答于 2025-03-28 13:17

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服务器putty上可以进行内存设定和线程设定吗?我按照基因家族环...

把这个参数去掉:--cpus 1

回答于 2025-03-26 09:35

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单细胞测序FindAllmarkers

没有找到差异基因,降低标准试试的: --logfc.threshold 0.15

回答于 2025-03-24 11:50

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进不去docker,镜像,虚拟机。

你检查你电脑C盘有share文件夹吗? 没有去创建一下:

回答于 2025-03-20 08:43

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GWAS图像问题

可以看看这个:https://www.omicsclass.com/question/7735

回答于 2025-03-19 17:44

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采用你们课程的:Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以...

关于你提出的曼哈顿图上面的点显示不全的问题,你可以对脚本进行如下的修改 找到y轴设置 修改一下: 即把脚本中的y轴坐标轴上限增加5% qqplot 也一样:

回答于 2025-03-14 18:50