TCGAbiolinks 下载临床数据,警惕有多次随访数据

TCGAbiolinks 下载临床数据,警惕有多次随访数据

在我们的《TCGA-生存分析》课程中,我们提供了临床数据的下载方法。有学员反馈,有些癌症有多次临床数据,随访时间还不一样。我细致的看了一下出现这种情况的原因:

1. 随访曾中断过: 存在多次随访

2. 出现了新的癌症:不同的癌症记录,随访时间不一样

3. 接受手术治疗: 接受了手术的治疗,增加了新的随访数据

这个临床信息非常的复杂,所以在分析数据时,一定要细致的查看临床数据的记录,做分析前,一定要做好数据的筛选工作。不然分析结果可能会存在问题。 




如果您对TCGA数据挖掘感兴趣,请学习我的TCGA系列课程:

  • 发表于 2018-08-01 14:04
  • 阅读 ( 3530 )
  • 分类:TCGA

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