数据分析代码2__用法

代码介绍

这个代码有两个主模块,DataFetcher and CountSummarizer

前者使用cr调用,用于从根据参考列提取数据,
attachments-2023-10-Eci9cknV6540c462ab7e2.png

比如有一个文件
attachments-2023-10-Fjs7T0u36540c4b43a4ea.png想根据这里的某一列提取行,参考数据如下
attachments-2023-10-3GLiK1fe6540c50d9175f.png

使用代码,得到结果
attachments-2023-10-wI35D1o16540c589ae986.png


后者使用ex调用,功能复杂一点,用法比较多不一一距离,常用于丰度估计

attachments-2023-10-nQMW1gjy6540c6010cbd2.png

比如一个物种分类表attachments-2023-10-TmVVXrwL6540c66b75b27.png然后我有名称对应的丰度表,比如
attachments-2023-10-YjVNOCqX6540c6da7b89b.png
显示不全,看着不对应,实际上是几万行相互对应的,我现在想知道每个分类层级那些物种都有多少丰度,就用代码

attachments-2023-10-vJEf5jgM6540c7bd73ea2.png生成了3个文件,
随便看一个
attachments-2023-10-ud4BevrS6540c8d79e9a3.png就是order级别各个物种在不同样本里的丰度占比

这个在功能注释里用的更多,有兴趣可以看一下,具体代码见文章

https://www.omicsclass.com/article/2329


  • 发表于 2023-10-31 17:32
  • 阅读 ( 313 )
  • 分类:软件工具

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