构建一致性序列

构建一致性序列

构建一致性序列方法如下：

1.将vcf文件压缩

bgzip -c  raw.filtered.snp.vcf > raw.filtered.snp.vcf.gz

2.建立索引

tabix raw.filtered.snp.vcf.gz

3.构建一致性序列

bcftools consensus -f Ghirsutum_527_v2.0.fa raw.filtered.snp.vcf.gz > new.fa






  • 发表于 2023-05-19 11:33
  • 阅读 ( 3084 )
  • 分类：软件工具

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
安生水
安生水

327 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 657 文章
  2. 安生水 327 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. 红橙子 78 文章
  6. CORNERSTONE 72 文章
  7. rzx 67 文章
  8. xun 66 文章

安生水

如果觉得我的文章对您有用，请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作！