Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么?

我们在做数据分析时,经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况,为了方便后续的数据分析,需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称...
我们在做数据分析时,经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况,为了方便后续的数据分析,需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。

Uniprot基因ID/名称转换方法

1、打开uniprot网站,https://www.uniprot.org;
2、点击“Retrieve/ID mapping”,跳转页面进入ID转换界面;attachments-2023-03-tVXEKY716411233826a42.png3、上传ID列表,选择转换类型,进行转换;attachments-2023-03-v6FaWODC6411233fc798b.png4、查看并下载转换后的数据。attachments-2023-03-FJ6EKJBq6411235d43704.pngBioDBnet基因ID/名称转换方法
1、打开网站https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php;
2、提交ID列表,选择转换类型,进行转换;attachments-2023-03-3HoKnVv1641123942e806.png3、查看并下载转换后的数据。attachments-2023-03-aWbJyN0b641123a81eea3.png

其他基因ID/名称转换方法

除去以上两种在线转换基因ID的网站之外,还有以下在线转换网站:
1、BioMart:asia.ensembl.org/biomart,该网站参数配置比较麻烦;
2、DAVID:https://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp,该网站参数配置一般,但是网站响应速度太慢。


  • 发表于 2023-03-15 09:49
  • 阅读 ( 4427 )
  • 分类:其他

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
生信老顽童
生信老顽童

59 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 657 文章
  2. 安生水 327 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. 红橙子 78 文章
  6. CORNERSTONE 72 文章
  7. rzx 67 文章
  8. xun 66 文章