Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么?

我们在做数据分析时,经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况,为了方便后续的数据分析,需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称...
我们在做数据分析时,经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况,为了方便后续的数据分析,需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。

Uniprot基因ID/名称转换方法

1、打开uniprot网站,https://www.uniprot.org;
2、点击“Retrieve/ID mapping”,跳转页面进入ID转换界面;attachments-2023-03-tVXEKY716411233826a42.png3、上传ID列表,选择转换类型,进行转换;attachments-2023-03-v6FaWODC6411233fc798b.png4、查看并下载转换后的数据。attachments-2023-03-FJ6EKJBq6411235d43704.pngBioDBnet基因ID/名称转换方法
1、打开网站https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php;
2、提交ID列表,选择转换类型,进行转换;attachments-2023-03-3HoKnVv1641123942e806.png3、查看并下载转换后的数据。attachments-2023-03-aWbJyN0b641123a81eea3.png

其他基因ID/名称转换方法

除去以上两种在线转换基因ID的网站之外,还有以下在线转换网站:
1、BioMart:asia.ensembl.org/biomart,该网站参数配置比较麻烦;
2、DAVID:https://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp,该网站参数配置一般,但是网站响应速度太慢。


  • 发表于 2023-03-15 09:49
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