synteny collinearity 区别

synteny collinearity 区别

在比较基因组学的时候,经常会听到“共线性”这个词,但是与其对应的有两个不同的概念,即

(1) synteny :

  • 同线性(synteny): 两个物种的几个同源基因分布在同一条染色体上,不需要考虑到基因之间的排布

(2) collinear

 

  • 共线性(collinearity): 两个物种的几个同源基因分布在同一条染色体上,并且基因之间的排布方式相同

二者的区别如下图所示:

 


attachments-2023-02-IVnUnEXi63f72b31895cb.png 

 

 

可以看到,syntenic,表示的共线性区域,其基因顺利可以不同

但是, collinear,表示的共线性区域,其基因顺序一致

  • 发表于 2023-02-23 17:01
  • 阅读 ( 938 )
  • 分类:基因组学

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