blastp 快速比对注释基因,输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1 -outfmt "6 qseqid sseqid qlen slen pident length  mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore qcovs stitle"  -out uniprot.blast.out.tsv


diamond blastp --query  best_candidates.fasta --db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta.dmnd --threads 10  --evalue 0.000001  --outfmt 6 qseqid sseqid qlen slen pident length  mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore stitle  --out uniprot.blast.out.tsv

  • 发表于 2022-11-21 16:35
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