singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件

singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件

第一种方法:直接在线转换

singularity pull rnaseq.sif docker://rnaseq:latest


第二种方法:有时候网速不好,可以用本地docker文件转换

#导出docker镜像
docker save omicsclass/rnaseq:latest | gzip > rnaseq.tar.gz  #镜像保存

#如果导出的镜像是gz压缩的需要解压成tar文件
gunzip rnaseq.tar.gz

#生成sif文件
singularity build  rnaseq.sif docker-archive://rnaseq.tar  #sif 文件


更多singularity 使用说明:https://www.omicsclass.com/article/1885 


  • 发表于 2022-11-05 20:22
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  • 分类:linux

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