基因entrez ID转换 Gene Symbol 名字 R语言

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setwd("/share/nas1/huangls/test/hypertension")

library(org.Hs.eg.db)
library(annotate)
df=read.table("GPL19109.soft.1",header = T,sep = "\t",stringsAsFactors = F)
df=df[!is.na(df$ENTREZ_GENE_ID),]
name=getSYMBOL(as.character(df$ENTREZ_GENE_ID), data="org.Hs.eg.db")
df$`Gene Symbol`=name
head(df)

  • 发表于 2022-02-24 15:50
  • 阅读 ( 2567 )
  • 分类:R

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