蛋白定量-Maxquant软件输出结果说明

之前小编在蛋白质定量—MaxQuant软件的使用这篇文章中分享了Maxquant软件的使用方法。分析完成后会产生很多的结果文件,第一次使用的同学可能会很困惑,这里再给大家介绍一下如何查看其结果文件...

之前小编在蛋白质定量—MaxQuant软件的使用这篇文章中分享了Maxquant软件的使用方法。分析完成后会产生很多的结果文件,第一次使用的同学可能会很困惑,这里再给大家介绍一下如何查看其结果文件。

结果解读

1.如果参数中路径没有额外设置,那么在原始数据同级目录下会得到搜库结果:attachments-2021-08-rS6dmiIF610a32ff6192a.png
其中,mqpar.xml是所有参数配置文件,若二次搜库,可直接导入MaxQuant中,无需重复设置。所以,一般建议保留下来,这样也可对结果的设置进行追溯。
2.combined文件夹包含了搜库结果,如果是DIA建库,导入的即是这个文件夹。attachments-2021-08-lVR6OFVb610a33115a160.png
其中proc文件夹下的#runningTimes.txt文件,记录了每一步运行的时间。

attachments-2021-08-WJYtCEMt610a33240a604.png
3.蛋白质鉴定和定量的全部结果都位于txt文件夹下。

attachments-2021-08-4wZcw5SY610a3335d5f09.png
其中msms.txt、peptides.txt、proteinGroups.txt分别为谱图、肽段和蛋白结果文件。另外summary.txt文件记录了所有原始数据文件的总体信息;evidence.txt文件记录了已鉴定肽段的所有信息。每个文件的列数(表头)都很多,就不一一列举了,需详细了解的同学可自行查阅结果中tables.pdf文件,所有文件都有详细解释。

好了今天先介绍到这里,你也动手去试试吧!


此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下:

1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程

2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读转录组(无参)结果解读

3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析

4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘

5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读

6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接:

http://m.study.163.com/provider/400000000234009/index.htm?share=1&shareId=1031480318

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
安生水
安生水

252 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 532 文章
  2. 安生水 252 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. 红橙子 78 文章
  6. CORNERSTONE 72 文章
  7. 生信老顽童 48 文章
  8. landy 37 文章