GWAS抗性性状处理,耐盐,耐寒,耐旱等

GWAS抗性指数处理,耐盐,耐寒,耐旱等

方法1:计算抗性指数用于GWAS分析

GWAS分析一些抗性指标时候,我们一般会做对照与处理,分别调查处理和对照的多种性状数据,然后计算抗性指数:

 The response of the genotypes to salt stress was expressed using the stress susceptibility index (SSI) calculated according to Fischer and Maurer39 using the following formula: SSI = (1 − Ys/Yp)/D, where Ys = mean performance of a genotype under stress; Yp = mean performance of the same genotype without stress; D (stress intensity) = 1 − (mean Ys of all genotypes/mean Yp of all genotypes).


方法2:苗期处理,利用死亡率做为抗性指标


参考文献:

https://academic.oup.com/dnaresearch/article/22/2/133/332691#4590366

Fischer R.A. Maurer R. 1978, Drought resistance in spring wheat cultivars. I. Grain yield responses, Crop Pasture Sci., 29, 897–912.



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  • 发表于 2020-12-17 18:14
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  • 分类:GWAS

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