主成分分析 - 组学大讲堂问答社区

主成分分析

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跟着文献学做图 | 用蛋白质序列做主成分分析（PCA）

提到主成分分析，一般我们都是使用Plink，GCTA等软件基于SNP数据来操作，那么如果我们用蛋白质序列，能不能做主成分分析，如何做呢？答案是可以做，让我们一起来学习怎样做出与文献一样的图吧~

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星莓发布于 2022-11-03 16:49

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使用DNA序列做主成分分析（PCA）——R语言adegenet包

提到主成分分析，一般我们都是使用Plink，GCTA等软件基于SNP数据来操作，那么如何用DNA序列做主成分分析呢？思路是先比对，之后使用R语言的adegenet包把比对的数据转换成snp数据，用到的函数是fasta2genlight()，再进行PCA分析及绘图。

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星莓发布于 2022-10-31 11:33

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主成分分析（PCA）如何计算方差解释率

我们常看到的PCA图中，每个成分都对应了每个特征方差贡献率。通常，求得了PCA降维后的特征向量，我们就可以绘图，但各个维度的方差解释率没有得到，就无法获得PC坐标的百分比。（文...

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星莓发布于 2022-09-02 11:05