针对数据文件，利用awk 判断符合条件的数据，并筛选出结果数据，输入到对应的文件中。 awk '{if ($7>5) print}' A|less ###筛选A文件中第七列大于5的数据，显示所有符合的结果 awk '{if ($6>5 && $7>5) print}' A|less ###筛选A文...
...键模块中的hub基因，同时结合生存分析、ROC曲线利用其他数据库数据进行验证并筛选最终Biomarker的过程。 背景简介 多形性胶质母细胞瘤是一种非常严重的脑瘤，占所有类型的15%左右，生存时间一般少于15个月，目前主要的治疗...
运行脚本04.PASA_assembly.sh，运行数据筛选出错（如下），系统提示：BLAST Database error: Error: Not a valid version 4 database. 搜索百度要么下载版本4的数据库，要么 更新blast+ （https://blog.csdn.net/zhangjunya/article/details/108279859）。查看了一...
一个基因有多个 isoform蛋白 建树时是否要都放进去
老师我有个蛋白 通过ncbi结构域搜索之后没有目标蛋白domain 但在注释文件中注释为我需要的目标蛋白 该怎么办
FPKM值≥1时有意义。有没有相关的文献做支撑
嫌色细胞癌属于肾细胞癌的一种，约占4-5%。利用公共数据库数据筛选此类癌症的相关biomarker进行有效的临床诊断和预后也是公共数据分析的一个方向。这里就给大家介绍一篇文献：利用WGCNA鉴定嫌色细胞癌biomarker。 数据来源从T...
如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据？这是困扰大多数老师的一个难题！ 以转录组为例，想要挖掘数据，首先要看得懂数据，这是基础。 接下来小编以一个excel的简单函数为例，演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣...
...件，还没有蛋白序列、CDS序列文件。 实验室有转录组的数据，请问我是否可以基于转录组数据，来找目标基因呢？HMM模型可以对核酸序列做筛选吗？ 谢谢老师！
...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...
...升序排序。 1. 批量筛选特定基因的表达量 做了转录组数据分析，通常公司会给我们一个所有基因在所有样本中的一个基因表达矩阵文件。有时候我们通过一些方法或者手段筛选到了一些基因，例如，特定功能的基因，差异表...
《基因家族分析》课中老师讲的主要是针对有基因组数据的物种进行了基因家族分析，那么对于没有基因组数据，只有无参转录组数据的植物，想研究一个基因功能，如何鉴定是否有基因家族成员，能否进行解释说明。 我从无...