动植物基因组课程,数据筛选步骤提示数据库错误

运行脚本04.PASA_assembly.sh,运行数据筛选出错(如下),系统提示:BLAST Database error: Error: Not a valid version 4 database.   搜索百度要么下载版本4的数据库,要么

更新blast+ (https://blog.csdn.net/zhangjunya/article/details/108279859)。查看了一下课程所用镜像和数据库,无法操作啊(能力有限),还是请老师帮忙吧,谢谢!!


#数据筛选

perl $scriptsdir/remove_redundant_high_identity_genes.pl best_candidates.gff3 best_candidates.fasta $threads 0.70 uniprot.blast.out.tsv > high_quality_gene.gff3


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  • cashing 提出于 2023-03-12 11:32

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