...胞，PI单阳细胞为裸核细胞。 流式检测细胞凋亡的数据分析方法： 1) 选中所有颗粒，将FSC和SSC设置成对数坐标轴模式备用; 2) 将横轴和纵轴分别设成Annexin通道和PI通道(7-AAD与此类似)，选取双阴细胞群; 3) 在双阴细胞门中，将...
接之前分析：1.玉米根热胁迫单细胞转录组复现2.玉米根单细胞转录组细胞类型注释代码3.热胁迫处理玉米根单细胞转录组差异基因分析 4.单细胞拟时序分析monocle2-代码 Monocle3于2020年正式发表，相比2017年发表于《Nature Methods》的...
我想做基因共线性分析，课程示例中的生成文件，我的数据库不全，我想要自己补全， 这是示例文件，我想问一下第二行gene_symbol:LON3 description:Lon protease homolog 3,mitochondrial [Source:UniprotKB/Swiss-Prot;Acc:Q9M9L8 ] 是必须有么？因为我这...
... 1.5. ceRNA 网络中的基因，lncRNA 进行表达量的相关性分析 1.6. ceRNA网络中miRNA, Gene, lncRNA 进行生存分析 1.7. ceRNA 网络中的基因进行GO,KEGG功能富集分析 2. 研究结果 2.1 差异表达分析 2.1.1 基因差异表达分析聚类...
cafe进行基因家族的扩张和收缩分析得到的结果应该怎么看？为什么结果里面统计的 扩张、收缩和保持不变 三者之和不等于 基因家族的总数？
在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍，这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树（Phylogenetic tree）。 在Orthofinder结果文件中有一个MultipleSequenceAlignments文件夹，里面有一个...
显示磁盘已满，进行报错，第二个样本中跑不出来out文件夹且比第一个样本中少东西，新建不了文件夹，后续进行不了，麻烦问一下老师怎样解决
...过生理生化指标检测、全长转录组与广泛靶向代谢组联合分析，揭示了ZmWRKY82转录因子通过直接激活ZmCHI6表达、促进类黄酮积累、清除活性氧（ROS）的关键调控网络，为玉米耐盐碱分子育种提供了新靶点和理论依据。 研究方法...
转录组测序应用越来越普遍，但其存在着数据量庞大，分析结果众多等不利于新手的问题，初次接触者眼花头大是常有的事，今天小编就拿一份典型的有参物种转录组结果文件，来给大家概述下各个文件夹里存放了什么，有什么...
LEfSe分析，可以分析组间菌群差异，找出各组间差异的微生物种类，有助于开发biomaker等研究，因此LEfSe分析在微生物相关文章中经常出现。我们今天来详细讲解一下LEfSe分析的原理及图表解读。 LEfSe分析原理 LEfSe软件用于发现...
...族基本都有保守序列 HDEIDFEFLG，但是在多序列比对和motif分析时，发现几个基因并没有文献提到的保守序列，请问这种情况怎么处理，是删掉这几个基因还是保留？
...颜色来分的，且都是edges的文件。 代码用的是课程里下载的无性状代码： 十分感谢老师百忙之中的帮助！ 我用课程的数据做了下，前面的图都还正常，到了这个图，跟我用自己的数据做出来的样子差不多，跟正常图比起来有...
...数 实际上是一个条件瞬间死亡率 。 基本原理 生存分析的主要目的在于研究变量X与观察结果即生存函数(累积生存率) 之间的关系。 当 受很多因素影响，即 为向量时...
老师您好，我分析的基因家族的一个成员是未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015），但是进行共线性分析时，发现有两个成员和未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015）的成员是大片段复制基因对（MdoChr03g1975:MdoScaf049s0015 MdoChr11g0239:MdoSca...