基因家族分析，既是一个可以快速掌握的生物信息分析技能，也是低成本SCI文章思路。基因家族文章写作模式相似，换个物种或者基因家族就又是一篇文章，可借鉴性很强，且发文数量依然不减，是低成本短、平、快SCI文章的经...
老师，我的基因全长1900bp，那么启动子分析脚本截取从ATG往上1500bp，即从第一个cds往上1500bp，我认为启动子序列不可能有1500bp啊，毕竟全长1900bp。可是运行脚本却能输出该gene的启动子序列。这是为啥啊？
...:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像，老用户重新下载示例数据压缩包 课程链接：https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ
inferCNV用于探索肿瘤单细胞RNA-seq数据，分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy number alterations, CNA)，例如整条染色体或大片段染色体的增加或丢失(gain or deletions)。工作原理是，以一组“正常”细胞作为参考，分析肿瘤细...
这是共线性分析视频中blastall 这一步报错如图： 具体： manager@bl8vbox[mcsanX] blastall -i pep.fa -d pep.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast [11:41AM] [blastall] WARNING: Unable to open output file mcscan/AT.blast: [blasta...
...在实验中都是”大事情“，如果你的细胞出现生长缓慢、不贴壁等情况，那你可要注意了，这就是细胞状态不好的信号，要及时“挽救”，不然很有可能细胞就濒临死亡。 问题一：细胞生长缓慢 细胞长得慢是细胞培养过程...
很多同学会有这个疑问：做生物信息分析对笔记本电脑要求高吗？我的笔记本够用吗？ 贵的笔记本性能就一定强吗？ 我发现目前网上这方面的信息很少，甚至还有些生信大V做错误的高中低配笔记本推荐，点进去一看“中配”...
如图所示。我想做基因家族分析，发现ID不对应，不知道是否影响后续工作，或者怎么才能统一ID
文件格式和文件名检查没有出错，报错内容和视频课中提示的报错也不一样
在使用最新版本Maxquant（MaxQuant 2.4.3.0）进行蛋白质搜库的时候，点击开始之后，会弹出一个弹窗，如下： 提示.NET Core SDK需要更新。 .net core 3.1更新教程： 进入下载网址：https://dotnet.microsoft.com/zh-cn/download/dotnet/3.1 选择所需版...
老师，您好，根据咱们转录组课程进行了实操，质控等正常，但是转录组数据比对到基因组这个步骤总是出现比对率只有零点几的情况，尝试了好几个转录组数据，从来没正常过。 水稻转录组测序数据显示如下，NCBI下载的单端...
老师，我做基因家族分析 下面是蛋白ID 下面是cds序列 下面是gff文件 获取基因与mRNA的对应关系perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt，提取到的ID=Zm00001d027240_T001，而在hmm搜索的结果ID=Zm00001d027240_P001，...
获得gene_exon_info.gff文件如下图 但GSDS分析时出现错误，如下图，line1怎么不符合格式？怎么修改？谢谢！ 根据老师的建议删除行末尾的；并改为UTF-8格式，仍然没有解决问题
下面这几个文件是从ensembleplant 网站下载的，Glycine_max.Glycine_max_v2.1.43.chr.gff3 ， Glycine_max.Glycine_max_v2.1.cds.all.fa ， Glycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa ，格式信息如截图所示（我在基因家族培训QQ群里发布的那张图是我自己尝试编辑修...