问题 老师，您好，GWAS，PCA和结构分析时，总是运行代码显示segmentation fault, 以为是容量问题，按照提供的方案从4G提升到了10G，但是还是显示segmentation fault，网上说编译plink的系统和运行系统不一致，是这样吗？感觉不是容量的问题，电脑换了win10和11，都是这样，你们编译的代码

问题 基因家族分析

你好，我想问一下，我看文章的基因家族分析都是以蛋白的保守结构域来命名的，就是我做一类基因家族，但是它的保守结构域跟蛋白家族命名不一致，写文章的时候怎么来写这个名字

问题 基因家族分析--定量问题

老师您好，我想问一下后面的定量分析可以用不同的种吗？用于鉴定的物种和定量用的物种拉丁文不太一样

问题 关于基因结构分析失败的原因分析

这是下载的基因组gff文件 这是分析得到的结构域序列的信息 老师您好，我在分析基因结构的过程中，发现自己总是无法分析得到结构，所得的基因结构gff文件总是空的，也就是0KB,以上是我分析要用的两个文件内部截图，请问...

文章 envfit()的线性拟合：非约束排序（PCA、CA、PCoA、NMDS）

...A、NMDS）中被动拟合解释变量在R中的实现方法在群落排序分析中，若我们想在排序图中尽量展示最大的物种矩阵的变差（variation）的同时，又想展示出环境变量（即解释变量）；或者当我们在约束排序（如使用RDA、CCA等）中发现...

问题 kaks分析复制基因

老师，上面是我整理的重复基因对，在运行kaks分析时，下面一直保存，是只能一对一对分析吗？ 因为报“not equal”，所以我用phy格式，但是一直显示不被识别，我phy是自动生成

文章 gsea-msigdb 数据下载

...合物条目的链接。 CP：经典通路 这个基因集是通过多个在线数据库整理而来。 BioCarta pathway database KEGG MEDICUS pathway database PID pathway database Reactome pathway database Wikipathways pathway database KEGG pathway database (canonical pathways gene sets) ...

问题 老师您好，我想请问在进行kaks分析时clustalw比对出现下面的问题怎么解决啊？

老师您好，就是kaks分析 要在虚拟机命令行里进行clustalw比对的时候，我要是用那个交互式他就是在我选这个2Multiple Alignments之后再选1Do complete multiple alignment now Slow/Accurate的时候就显示图片这种ERROR:No sequences in memory.Load sequences fir...

问题 TCGA的RNA-seq count annotation过滤，有些不知道是否需要删除

比如 * platform：NA 1. patient_annotation：Observation:General:This subject was duplicated by TCGA-24-0981; 0981 was redacted and this one retained 2. patient_annotation：Notification:Item in special subset:This is part of the ovarian triplet set. 3. aliquot_annotation：CenterNotification...

文章 文献解读 PPT 构架与内容生成导师

...流向图展示：样本 ➔ 分组 ➔ 对照 ➔ 测序方法 ➔ 比较分析。 • 逻辑自洽：不允许只写步骤。每一组箭头的上方或下方，必须用一句话解释**“为什么要这么设计（Why）”**（例如：设置此对照是为了排除 的干扰）。 • ...

问题 GSEA分析为何

利用GSEA分析之后，出现的结果里面突然不明白，Table: GSEA details 里面应该是包含这个GO set的所以基因的意思，后面yes表示上传数据有这个基因 那个core enrichment含义是什么。。。。

问题 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后，染色体出现了一个超级染色体，各染色体大小分布非常不均匀

...不均匀，出现了一条超级染色体，如下图：希望帮忙看看分析代码问题（附件：1组装流程简化.sh），下文为简单的分析流程总结。

问题 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

mcscanX分析时用的是蛋白比对，在筛选基因家族串联重复基因对的时候未筛到，用了课程里的筛选方法，发现用的是CDS比对，我想问下哪个更准确？？？筛选结果不一样~

问题 mcscan共线性分析

请问一下mcscan分析时，蛋白序列per.fa文件里是3w多基因，计算后图中标识这里是9W多，不知道什么原因啊？基因组怎么会有9万多基因呢？

问题 老师好，我可以用windows桌面版的docker在powershell上利用ssh命令链接到服务器进行重测序数据分析嘛，之前直接用笔记本不连服务器感觉电脑要炸了烫的，在服务器安装docker几次都失败了，买了安装课程可是只有windows的安装教程，还是没搞定