3 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

mcscanX分析时用的是蛋白比对,在筛选基因家族串联重复基因对的时候未筛到,用了课程里的筛选方法,发现用的是CDS比对,我想问下哪个更准确???筛选结果不一样~

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最佳答案 2019-11-30 08:48

蛋白质和cds序列都可以;但是由于用mcscanX和blast方法去筛选可能导致结果不一致,结果任选其一就行;

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其它 1 个回答

余生

谢谢老师

那老师如果我用mcscanX分析基因组内共线性,画基因组的共线性图,用blast分析基因家族内的共线性,然后组合起来画图,文章里说明白就行吗?

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  • 余生 提出于 2019-11-25 20:39