找到约 15 条结果

问题 老师您好,请问个人电脑改装成Linux系统的话配置为32g 加 2T,跑小麦数据可以嘛?

问题 老师,你好!ATAC-seq数据分析中,peak是clean reads拼接后得到的序列么?

问题 老师,您好!我同时测了二代和三代转录组,都是无参,数据看不懂,有没有这方面的课程?

文章 串联重复基因 tandem和segmental的区别与联系

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 linux sed命令,如何替换换行符“\n”

...后来,经查sed官方用户手册,才得知,sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline,其实就是行的分隔符即换行符。 如果非要使用sed命令,实现替换file文本内容的换行符为空的话,那么...

问题 TCGA分析得到的risk score如何用自己的数据进行验证,定量pcr可以吗?

通过学习TCGA生存分析课程,得到了几个基因的risk score,但现在我想用自己的样本进行验证,是不是必须测序,就用定量pcr可以验证吗,该怎么计算?

问题 请问三倍体重测序数据可否用于2n配子形成机制的研究

... 有一个关于三倍体的疑惑,想请教:通过送样重测序和数据分析,能解决这个问题吗? 母本发生自然突变,得到2n配子,与父本正常配子n杂交,得到三倍体子代3n。 2n配子形成方式,主要有两者类型,FDR和SDR: 第一次减数分...

文章 KEGG数据库-pathway注释信息下载

前面我们介绍KEGG数据库下载中前两部分: 1. KEGG 中蛋白序列的下载 2. 蛋白对应的pathway 相关注释 有了这两部分,我们就可以对不同物种的氨基酸序列进行注释分析。如果要对蛋白在pathway上进行可视化标注,那就需要下载pathwa...

文章 群体遗传进化分析用MEGA

...去进行其他的分析,同样会是“nc”,例如下面这张表格的数据就是基于Ts/Tv的结果计算了遗传距离,导致遗传距离的结果也无法计算。(Oppen M J H V 2004) 那么我以自己的例子来演示一下,当我的Ts/Tv数据为“nc”,进行一个遗...

问题 我在NCBI上下载的CDS数据,在进行提取基因家族的CDS序列时,提取不出来

我看到CDS文件里的ID与基因家族ID不对应,多了前缀和后缀,然后我想询问老师怎么在notepad里批量删除以下的信息

文章 回归分析中R2的意义

...到。一般应该在0.99以上。越接近1,说明这条直线与原始数据(实际测量数据)越吻合。 当根据实验数据进行曲线拟合时,实验数据与拟合数据之间的吻合程度,用一个与相关系数有关的量R的平方来评价,R2值越接近1,吻合程...

问题 下载甲基化数据时找不到样本类型,

...##############################################> # 1. 下载TCGA甲基化数据> ############################################################> # 查询需要下载的甲基化数据(本次分析只下载肿瘤样本)> query.met <- GDCquery(project = tcga_project, +          ...

问题 请问一下,当用时期作为表型数据时,文件该是什么格式?行和列各怎么赋值,还有就是重复间要不要区分?

问题 OMIM数据库位置信息是hg19/GRCH37还是hg38/GRCH38为参考的?

What reference assembly does OMIM use for the genomic coordinates?

问题 各位老师,请问一下DEseq2差异基因分析所用得到数据是expected_count值,还是FPKM值啊