请问基因组间的共线性分析为什么要对共线性区域进行过滤？用anchors文件而不是anchors.new直接作图不可以吗？因为基因家族的成员有的落在小于30的区域中，所以过滤后就不会在图中显示。 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.c...
GeneDoc是一款多序列编辑分析软件，能用亮丽的色彩来区分相互间序列的同源性，并可以以各种方式标记序列，生成发表质量的输出报告，也支持进化树的分析报告，也可用于分析生物分子中结构和功能之间的关系。 这里简单介...
...果“1”中的转录组数据可以合并使用，表型数据的关联分析是什么逻辑呢？是不是直接利用NCBI上的RNA-seq数据，然后结合自己测定的一些RNA-seq和表型进行相关分析呢？》、
...变更的原因 一般来说，软件开发项目的流程是：需求分析—开发部门架构和开发系统—测试部门测试系统—用户测试系统—系统上线。 需求变更在任何时候都有可能产生，产生的原因通常来源于内外部，包括产品经理、开...
想做生物信息分析，但不知道怎么入门？先来搭个环境吧！想分析数据，但是分析不了？先来搭个环境啊！搭建好环境，后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows，而很少使用Linux，然而做生物信息分析是需要用Linux...
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
Broad GDAC对TCGA的结果进行了整理和深入分析，相关的原始数据和分析结果可以通过网页的方式进行查看和下载， 网址如下：http://gdac.broadinstitute.org/ 点击Cases可以查看对应的样本信息，点击Data可以下载对应的结果文件，点击Bro...
关于物种组成数据Hellinger的转化 一般而言，对于物种组成数据较少使用PCA这种线性模型去做，PCoA或NMDS等是比较推荐的。 如果仍要使用PCA的话，事实上，并不是说物种多度数据一定要作转化才行。如果物种多度数据比较均匀，...
NCBI下载的数据，用samtools生成的fai文件和视频课里面的不一样，后生成gene_chr。txt是空文件。
Error, no sequence for Scaffold1 at /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl line 84. 应该如何解决？代码与报错如下， 我的基因组gff文件是这样的，我看课程示例文件是ID=XX;Parent=xx,是因为这个才提取不出来吗
基因家族分析植物中非常常见，动物多见鱼类等海洋动物，牛羊等大型动物的基因家族分析文章比较少，那么大型动物能不能整理基因家族分析类文章呢？答案是肯定的，今天，我就给大家介绍一篇2022年1月11日见刊的介绍牛中Wn...
...产品规划。 根据市场调研，包括行业趋势调研、竞品分析等，建立商业需求文档；对用户需求调研，包括目标群体的研究，需求挖掘，聆听用户的需求倾诉等等，建立产品需求文档。 对以上两方面分析得出的结果对产品进...
像这个例子所示，collinearity文件第三组结果应该是串联复制基因吧？另外三组结果应该是大片段复制的基因。那么如果是这样的话在circos制图时第三行的结果是不是可以删除不进入圈图？
...致，防止下载时出错导致数据丢失，进而影响后续数据的分析。那怎样进行校验呢，不要急，往下看。 MD5校验工具 网上可以校验MD5的软件有很多，这里我们简单介绍几个。 1.MD5Check 下载链接： https://www.softpedia.com/get/System/Fil...