请问基因组间的共线性分析为什么要对共线性区域进行过滤？用anchors文件而不是anchors.new直接作图不可以吗？因为基因家族的成员有的落在小于30的区域中，所以过滤后就不会在图中显示。
/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.synteny screen --minsize=0 --minspan=30 --simple ATH.rapa.anchors ATH.rapa.anchors.new
谢谢解答！
这个根据自己分析数据的需要进行过滤，如果不过滤有些区域太短有可能不可靠。 自己分析可以适当调低这个参数。
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