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文章 IF=3.47|非肿瘤-眼部老年黄斑变性ceRNA文章思路

...掘胰腺导管腺癌预后关键基因文献精读-GEO数据挖掘生物信息文章(宫颈癌)GEO数据挖掘直肠GEO数据挖掘案例解读-植物篇(拟南芥重金属)GEO数据如何挖掘?案例解析!胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-糖酵解IF=6.58|铁死亡相关l...

文章 第11期《基因家族分析实操培训班》邀您参加!

...名吧! 报名链接:https://www.wjx.top/m/46969689.aspx 优惠信息: 1. 赠送价值499元2019年版《基因家族分析》视频课程及价值199元《Linux系统的使用》;已购买过该课程的报名人员,则按实际购买价折现予以优惠; 2. 团报优惠,2人...

文章 200+篇基因家族分析文献免费领取!

...家族分析类文献,汇总成EXCEL,供大家参阅;此EXCEL包含信息如下:文献题目、期刊名称、影响因子、第一作者姓名、通讯作者姓名、发表时间、全文下载链接、一作单位名称,部分文献列表见下图(领取方法见文末): 2021年...

文章 史上最有个性的论文盘点,你一定没见过!

...篇论文写短一点、再短一点、甚至短到几乎没有,在这个信息爆炸、注意力频频转移的网络时代,真的是难能可贵。以上。看完这些有脾气的论文,你有什么想法?学霸姐姐看着自己吭哧吭哧、字字斟酌、改了无数次的论文,表...

文章 8.28接收-毛竹bHLH基因家族分析文章解读及原文献下载

...O注释,简单介绍了注释情况,并根据GO注释中亚细胞定位信息统计了候选基因亚细胞定位情况。 5. 毛竹中bHLH基因家族基因启动子及表达模式分析 由于本文研究的基因家族是转录因子,所以可以对家族内基因启动子区域进行...

文章 ggbio绘制基因结构图​

...备 需要准备gff文件,保留自己想要展示的元件及其位置信息即可。 存在overlap关系的元件需要进行取舍。 原始数据: 操作: # 选择展示exon和UTR区grep "AT1G01010" TAIR10_GFF3_genes.gff | awk '$3!~/[gNCDS]+/' | grep -v "protein" > test.gff 之...

文章 MUSCLE软件介绍

...:00:00    12 MB(-1%)  Iter   1  100.00%  Root alignment 4、生物信息中的利用 目前muscle 主要用来在基因组进化部分,因为构建进化树和计算选择压力,都需要将序列对齐,muscle小而快,毋庸置疑是最好的选择。 参考资料 【1】常...

文章 100个接收基因家族分析类论文的期刊汇总!速领!

...家族分析类文章的期刊,供您投稿时参考! 此Excel包含信息如下:期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科院分区、大小学科分类、录用比例、审稿周期、期刊主页网址,部分期刊列表见下方截图(领取方法见文末): 如您...

文章 胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-糖酵解

...掘胰腺导管腺癌预后关键基因文献精读-GEO数据挖掘生物信息文章(宫颈癌)TCGA数据库挖掘-肾细胞癌相关biomiarker筛选案例解析TCGA数据库中临床样品编号详解(Barcode)GEO数据如何挖掘?案例解析!TCGA数据下载—TCGAbiolinks包参数...

文章 启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库!

...过实验验证。该数据库包含来自十余种物种的启动子序列信息(如下图),界面友好,操作简单,适合小白操作学习。 1. EPD界面非常简单,如下图所示可在是检索框输入基因ID或者基因名(gene symbol),再选择物种,点击search即...

文章 如何用R语言绘制进化树+热图

系统进化树:也叫作聚类树或者进化树,是生物信息学中描述不同生物之间的相关关系的方法。 作用:通过绘制进化树分析可以了解所有生物的进化历史过程系统发育树的主要构成、找出不同物种间的进化关系、理解祖先序列...

文章 TCGA数据库中应该下载哪种表达量数据HTSeq-Counts,HTSeq-FPKM,HTSeq-FPKM-UQ

...例来说明两者的差别: 假设在样品1中Gene A 的相关统计信息如下:     1. Gene A的长度为:3000      2. 比对到Gene A上的reads数量:1000     3. 比对所有基因上的reads数据量:1,000,000     4. 样品1中覆盖75%基因的reads数:2000  那...

文章 enrichGSEA_pip.r GSEA富集分析

...差异基因分析所以的结果; 必须含有log2FC这列差异倍数信息,用于GSEA排序; -g 指定 gmt文件  基因集: 更多GSEA功能富集数据下载:http://software.broadinstitute.org/gsea/downloads.jsp#msigdb 使用举例: #更多GSEA功能富集数据下载:htt...

文章 IF=13.8 | 青藏高原人群肠道微生物生物标志物的荟萃分析及微生物群衍生的丁酸盐在高海拔适应中的功能

...了688个公开的肠道微生物组数据集,包含了参与者的基本信息、疾病状态、饮食习惯和生活方式等。在这些样本中,有263个低海拔汉族样本(LH)、105个高海拔汉族样本(HH)、60个低海拔藏族样本(LT),以及240个高海拔藏族样...

文章 compare_stat_boxplot.r metadata中变量分组T检验比较并绘制box图

... merge_tsv_files.r  或者  merge_metadata_genexpdata.r  将比较的信息合并到metadata中: usage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/compare_stat_boxplot.r       [-h] -m filepath -v variate [variate ...] -g group [-b groupby]       [-G geom] [--addDot] [-p palette [pa...