找到约 15 条结果

问题 请问老师，motif分析之后，html文件打不开，显示如下

not well-formed (invalid token) at line 177, column 44, byte 5589 at /biosoft/miniconda/envs/genefamilyenv/lib/meme-5.1.0/perl/CheckingSAX.pm line 46.Warning: meme_xml_to_html exited abnormally and may have failed to create HTML output.

问题 老师您好，我在文件共享时出现不能共享的问题，具体操作如下：

sudo mount -t vboxsf windows-share /home/manager/share 结果为：/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such device，该怎么解决，谢谢

文章 收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解

...目前网站接受多种形式的id，包括Entrez Gene ID，RefSeq (RNA and Proteins)， Gene Symbol and aliases，Ensembl (Gene, Transcript, Protein)，UCSC，UniProt。 用户输入需要分析的基因并提交，网站会对提交的基因id进行识别鉴定，之后可以选择分析方式...

文章 linux中查找包含指定内容的文件

...名为.log的文本文件，并找出包含”ERROR”的行  find / -type f -name “*.log” | xargs grep “ERROR”  例子：从当前目录开始查找所有扩展名为.in的文本文件，并找出包含”thermcontact”的行 find . -name “*.in” | xargs grep “thermcontact” ...

问题 请问老师R脚本运行后没有图片输出怎么处理？

Fst和pi一起做选择清除分析，报错：z Fst quantile:  0.7538857 1.410428 1.95557 2.640438  log2 Pi ratio(popa/popb) quantile:  0.4297574 0.8249645 1.297266 4.702742  Error in dev.off() : cannot shut down device 1 (the null device) Execution halted

文章 数据分析代码2__用法

这个代码有两个主模块，DataFetcher and CountSummarizer 前者使用cr调用，用于从根据参考列提取数据， 比如有一个文件想根据这里的某一列提取行，参考数据如下 使用代码，得到结果 后者使用ex调用，功能复杂一点，用法比较...

问题 老师您好，我在用MEGA11建系统发育树时出现了错误的提示

MEGA failed to parse the input file:Invalid base found:1(in line 4）

问题 您好，我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时，参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行不了？请您指教

...式植物的，用你们的demo，准备GO 注释数据，(species=sss_aa)(type=consortium)(curator=GO) i0_HQ_W_c10162/f2p0/728 = 0015078 i0_HQ_W_c10176/f5p0/771 = 0006457 我这个格式有错吗？ 谢谢， 照你们的demo描的，但是运行没有结果。请问何原因。能提供准确的de...

问题 WGCNA TOM可视化报错

... in checkAdjMat(adjMat, min = -1, max = 1) : some entries are not between-1and1 请问老师这一步该如何解决

问题 根据log文件判断进化树最佳模型

...0.850      51 Optimal log-likelihood: -8620.640      52 Proportion of invariable sites: 0.021      53 Gamma shape alpha: 7.556      54 Parameters optimization took 1 rounds (0.100 sec)

问题 请教老师，Gemma分析时的报错问题？

[root@iZ2e]# ./gemma-0.98.5-linux-static-AMD64 -bfile c -k output/result1.sXX.txt -lmm 1 -p p.txt -c c.txt GEMMA 0.98.5 (2021-08-25) by Xiang Zhou, Pjotr Prins and team (C) 2012-2021 ERROR: Enforce failed for file_kin output/result1.sXX.txt: open file in src/param.cpp at line 934 in CheckParam

文章 Cox与KM生存分析及结果解读

...mula = Surv(time, status) ~ sex, data = lung)  n= 228, number of events= 165        coef exp(coef) se(coef)      z Pr(>|z|)   sex -0.5310    0.5880   0.1672 -3.176  0.00149 **---Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ...

文章 快速解读：3-5分的蛋白质组学文章思路

...大家重点介绍一下转录组测序分析的相关知识。 Question and Answer 1、什么是转录组测序？ 转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研...

文章 快速解读：3-5分的蛋白质组学文章思路

...大家重点介绍一下转录组测序分析的相关知识。 Question and Answer 1、什么是转录组测序？ 转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的集合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研...

问题 R下载GEO数据没有显示GSM1625995 = col_double()

...gov/geo/series/GSE8nnn/GSE8205/matrix/GSE8205_series_matrix.txt.gz'Content type 'application/x-gzip' length 2228220 bytes (2.1 MB)downloaded 2.1 MBParsed with column specification:cols(  .default = col_double())See spec(...) for full column specifications.File stored at: D:/GEO/Download/GPL1901.an...