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文章 一文教你使用Excel画GO富集分析图

...20个富集条目进行富集分析作图。作图时,我们选择图上显示Term_type、Description、Corrected_P-value共三个值,当然你也可以显示Rich_factor而不显示Corrected_P-value。由于Corrected_P-value值从0-1都有,大小不一且差距较大,为了方便作图,我...

文章 OTU互作网络分析用MENA

...,包括文件大小,格式等等(下图)。提交成功后会自动显示上传数据的大致信息,包括样本数量、OTU数量等等。 提交成功后会自动显示上传数据的大致信息,包括样本数量、OTU数量等等。 构建网络 点击左侧Construct the network...

问题 超大的文本文件如fasta,fastq文件在windows中如何打开

1.7G的fa文件用什么工具可以打开,editplus和notepad++都打不开。

文章 电脑双显示器如何配置?

...!一竖置屏,一横屏更是完美搭配! 那么电脑设置双屏显示或多屏显示有什么用?怎么设置双屏或多屏显示呢?下面小编简单介绍一下它的作用以及具体的操作方法吧! 多屏的优点: 1. 显示相同画面,但大屏更精彩。 2. 多...

文章 Mapchart绘制基因染色体位置图时加标尺

绘制图片时可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置,方法如下: 选择tools -> chart options , 在 Loci 中选择 Ruler at page margin。 结果如下: 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可...

文章 GEO 数据介绍及在线下载

...据类型: 说明: 数据类型描述数据解释(解压后可用notepad++打开)SOFTSOFT formatted family file(s)平台信息芯片中探针与基因的对应关系注释文件,样品单独的表达量,所有信息文件MINiMLMINiML formatted family file(s)XML格式的所有数据...

问题 用GenomeScope软件预测基因组偏小

...用GenomeScope软件预测一个种质的基因组大小的时候,结果显示基因组大小是348M。但是,我做kmer分析的时候,kmer总数量是16756256187,主峰的深度是42,这样计算的话(kmer数量除以深度)基因组大小应该是397M。而且测序公司也做了...

文章 Mapchart 添加标尺

...置图 (https://www.omicsclass.com/article/397),图片中可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置: 设置初始图片后,选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置成 Ruler at page margin 结果: 推荐课程:...

问题 MCScanX运行无结果

...两个菌的gff文件简化并合并在一起的结果: 然后运行显示如下: 无结果啊啊啊啊!!!这是为啥,看了大家之前的提问,我对比了文件也没啥问题,而且这两株菌有很高的相似性,不可能没有共线性结果,还请大家帮我看...

文章 做韦恩图?自己搞定!

...粗细以及颜色等。点击每个区域的数字,在左侧下方可以显示该区域的基因列表。右键鼠标选择“图片另存为”可以保存图片,格式为PNG。 2. Draw Venn Diagram 软件地址:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/ Draw Venn Diagram 能够绘...

问题 motif绘图时,tbtools图上显示的motif跟meme.txt文件的不一致

...motif,-minw 6 -maxw 100  生成meme.xml文件放进tbtools里,图上显示几乎每个基因都有motif7、1、8、2,但是检查meme.xml文件和meme.html文件里只有部分基因具有这些motif,遇到这种情况怎么办?有没有遇到过相同问题的同学老师,麻烦指点...

问题 泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后,显示没有权限

ls -l A2pan-genome.pep.fa 然后使用这个指令 由于文件权限设置为 -rw-r--r--,这意味着只有文件所有者(在这个例子中是root用户)可以写入或修改这个文件,而所有用户(包括文件所有者、用户组成员和其他用户)都可以读取这...

文章 Mapman对表达数据进行聚类分析

...cluster data 在弹出框中选中mapping进行分析 2、途径2 主显示窗口选中cluster experimental data... 弹出的窗口中确定样品与mapping进行聚类 3、结果--获得的结果中涉及了具体的clustet数,单击对应的图片会显示具体的cluster结果,每个...

问题 LTR注释结果

...ever这三款软件对LTR进行注释,最后在.LTRlib.fa 文件的结果显示的LTR序列总长才23Mb。23Mb和公司注释出来的4Gb也相差太大了吧,,况且一个9G的基因组,LTR也不太可能只有23Mb吧。这其中是有什么说法吗?期待老师的解答

文章 在线绘制差异基因kegg注释图

...成“green”,这样后面做出来的kegg注释图里上调基因就会显示为红色,下调基因显示为绿色。具体方法是在第三列插入一个“if”函数,当第二列值为“up”时输出“red”,否则输出“green”,参数设置详见下图: 这样C2单元格...