找到约 15 条结果

文章 Mapchart 添加标尺

...置图 (https://www.omicsclass.com/article/397),图片中可以直接显示基因位置数据,此外还可以转换成标尺的形式显示位置: 设置初始图片后,选择Tools-->Chart options-->Loci -->Positions设置成 Ruler at page margin 结果: 推荐课程:...

文章 一文教你使用Excel画GO富集分析图

...20个富集条目进行富集分析作图。作图时,我们选择图上显示Term_type、Description、Corrected_P-value共三个值,当然你也可以显示Rich_factor而不显示Corrected_P-value。由于Corrected_P-value值从0-1都有,大小不一且差距较大,为了方便作图,我...

文章 在线绘制聚类热图(heatmapper)

...置; 2、支持样品和基因的双聚类; 3、支持基因名称的显示; 4、支持多种格式图片的下载。 绘图之前,需要准备相应的数据文件。在这里小编使用的是基因的表达量数据来绘制聚类热图。 数据文件准备好之后,需要把该...

文章 GEO 数据介绍及在线下载

...据类型: 说明: 数据类型描述数据解释(解压后可用notepad++打开)SOFTSOFT formatted family file(s)平台信息芯片中探针与基因的对应关系注释文件,样品单独的表达量,所有信息文件MINiMLMINiML formatted family file(s)XML格式的所有数据...

问题 motif绘图时,tbtools图上显示的motif跟meme.txt文件的不一致

...motif,-minw 6 -maxw 100  生成meme.xml文件放进tbtools里,图上显示几乎每个基因都有motif7、1、8、2,但是检查meme.xml文件和meme.html文件里只有部分基因具有这些motif,遇到这种情况怎么办?有没有遇到过相同问题的同学老师,麻烦指点...

文章 做韦恩图?自己搞定!

...粗细以及颜色等。点击每个区域的数字,在左侧下方可以显示该区域的基因列表。右键鼠标选择“图片另存为”可以保存图片,格式为PNG。 2. Draw Venn Diagram 软件地址:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/ Draw Venn Diagram 能够绘...

问题 泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后,显示没有权限

ls -l A2pan-genome.pep.fa 然后使用这个指令 由于文件权限设置为 -rw-r--r--,这意味着只有文件所有者(在这个例子中是root用户)可以写入或修改这个文件,而所有用户(包括文件所有者、用户组成员和其他用户)都可以读取这...

文章 Mapman对表达数据进行聚类分析

...cluster data 在弹出框中选中mapping进行分析 2、途径2 主显示窗口选中cluster experimental data... 弹出的窗口中确定样品与mapping进行聚类 3、结果--获得的结果中涉及了具体的clustet数,单击对应的图片会显示具体的cluster结果,每个...

问题 LTR注释结果

...ever这三款软件对LTR进行注释,最后在.LTRlib.fa 文件的结果显示的LTR序列总长才23Mb。23Mb和公司注释出来的4Gb也相差太大了吧,,况且一个9G的基因组,LTR也不太可能只有23Mb吧。这其中是有什么说法吗?期待老师的解答

文章 在线绘制差异基因kegg注释图

...成“green”,这样后面做出来的kegg注释图里上调基因就会显示为红色,下调基因显示为绿色。具体方法是在第三列插入一个“if”函数,当第二列值为“up”时输出“red”,否则输出“green”,参数设置详见下图: 这样C2单元格...

文章 关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题

...具体基因ID是什么或者Gene Symbol是什么,这些并不能直观显示。可以通过以下方法进行解决: 1、输入文件为差异表达分析的结果文件,文件中第一列是基因ID,有时会添加第二列Gene Symbol作为补充信息,其他为差异分析的结果...

问题 hmmer搜索结构域

...移以下,如图:,结构域缺失较多的基因,CDD数据库中却显示有结构,是不是要个别调整一下,还是遇到了那种正负链结构不同的比如这种,是不是要从正链调整到负链,这种怎么调整呢

文章 手把手教你使用GSEA分析!

...成功,如果比的数据格式不符合软件的要求箭头三处也会显示数据载入失败及原因(可以通过错误原因修改数据)。 第二步设置参数;数据载入成功,点击Load data下面的Run GSEA,就会出现下图界面:我们用不同的数字标记一下...

文章 技术贴-agriGO简单好用的GO富集网站来一个!

...ool”进入分析界面,选择SEA,此时会根据选定的分析内容显示需要设置的分析选项,SEA的分析界面如下图所示。 各种分析具体概念解释和内容都将在页面的右侧显示,例如SEA分析就是传统的富集分析过程。而选定分析之后要确...

问题 在进行KAKS计算时出现不报错,但结果文件是空的现象

...ing...<br>manager@bl8vbox[dupl-id1]  这是无结果文件输出的显示! manager@bl8vbox[dupl-id1] /home/manager6/KaKs_Calculator2.0/KaKs_Calculator2.0/bin/Linux/KaKs_Calculator -i 1.axt -o kaks1.txt<br>Method(s): MA<br>Genetic code: 1-Standard Code<br>Please wait whil...