搜索10个motif,-minw 6 -maxw 100 生成meme.xml文件放进tbtools里,图上显示几乎每个基因都有motif7、1、8、2,但是检查meme.xml文件和meme.html文件里只有部分基因具有这些motif,遇到这种情况怎么办?有没有遇到过相同问题的同学老师,麻烦指点一下~感谢感谢!
tbtools生成图里几乎每个基因都有motif1(绿色):
meme.xml文件里只有这一部分基因含有motif1:
题主解决了吗 我也遇到这样的问题
可能是MEME本身输出.txt文件的问题,不完整。去解析.xml文件貌似才是最完整的。
(doi: 10.1371/journal.pcbi.1008991)