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文章 什么是RIN值？！

...品之间的比较成为可能，并确保实验的重复性。更多详细信息参见安捷伦公司的应用简报，链接：https://wenku.baidu.com/view/90ab7b29370cba1aa8114431b90d6c85ed3a8887.html。 不同物种RIN形式 动物样品胶图上可见目的条带为28S、18S、5S，植物样...

文章 ggplot2主题theme参数

...图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 18年上半年，利用GEO/TCGA数据库发表文章超过1000+

...，特地将2018年利用GEO数据库和TCGA数据库发表的所有文章信息整理成EXCEL；此表包含信息如下：文献题目、期刊名称、期刊影响因子、一作姓名、通讯作者姓名、发表时间、全文下载链接、一作单位名称，如下图：（文末有索取...

问题 各位老师好，在做mcscanx共线性分析的时候，提取pep.fa的时候，pep.fa应该是输出文件，结果报错Could not read file 'pep.fa': No such file or directory

脚本内容如下 报错信息如下 如果创建了pep.fa的空白文件的话程序可以正常运行，但是文件没有输出结果。 希望各位老师能够答疑，小弟感激不尽！

文章 csvtk，A powerful software for handling CSV files

...对于经常处理CSV文件的人来说，特别是在数据科学、生物信息学以及任何需要数据分析的领域，CSVTK都是一种非常有价值的工具。 CSVTK的最大优点之一是其跨平台兼容性，这意味着你可以在各种操作系统中使用它，包括Windows、ma...

文章 对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？

...个物种的Org类型的包，包含了这些模式物种的GO及KEGG注释信息： 然而水稻的注释包在Bioconductor是下载不到的，有两种解决办法： 一种是利用AnnotationHub在线检索抓取OrgDb, 但是这些包是用ENTREZID，需要先将RAP-DB或者MSU转为ENTREZID...

文章 NCBI下载的10X 空间转录组数据如何读入spaceranger

...按上述命名规则重新命名文件：fastq文件夹 空间图像信息,放在spatial文件夹： spaceranger读人数据分析； spaceranger count --id=ATC4 --transcriptome $refdir \ --fastqs=./GSE250521_Thyroid/fastq/ --sample=ATC4 \ --unknown-slide=visium-1 --lo...

文章 Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

... 更多脚本参数设置及说明 可以通过-h参数获得以下帮助信息： usage: single_cell/cell_trajectory.r [-h] -i rds_data [--assay assay] [--Customization] [--marker.genes marker.genes] ...

文章 1000G千人基因组人群分类亚群缩写对照

...址：http://www.internationalgenome.org/category/population/ 了解分类信息，有助于研究特定人群中突变的等位基因频率： There are 26 different populations which are part of our study from many different locations around the globe. The following table lists these populatio...

文章 CentOS linux的环境变量配置

...习课程里面有详细说明：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、

文章 circos当中的颜色介绍

...circos.ca/documentation/tutorials/configuration/colors/lesson 更多生物信息课程：https://study.omicsclass.com/index

文章 如何看懂从TCGA下载的甲基化数据

...了样品中不同甲基化位点的甲基化程度β值和位点的注释信息。该数据的表头解释如下： Composite ElementA unique ID for the array probe associated with a CpG siteBeta ValueRepresents the ratio between the methylated array intensity and total array intensity, falls betw...

文章 USB挂载到KVM虚拟机

...整个 USB 硬盘当作物理设备挂给虚拟机。 确认 USB 设备信息 lsusb 输出类似： Bus 002 Device 004: ID 1234:5678 SanDisk Corp.记下 Bus 和 Device，或者用 /dev/disk/by-id/ 也可以定位。 编辑虚拟机 XML virsh edit k10virsh edit k10 在 <devices> 标...

文章 8月相约南京--群体遗传进化GWAS分析、T2T基因组、泛基因家族、宏基因组等主题培训！

...讲堂掌握生信技能吧！！ 点此处“联系客服”咨询详细信息！！！！ 组学大讲堂线下课程特点： ① 课程针对0基础学员设计，半自动化分析； ② 采用docker虚拟机技术，不同操作系统保持一致分析步骤； ③ 云服务器上...

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...大讲堂”有更多精彩教程视频供您观看学习。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...