18年上半年,利用GEO/TCGA数据库发表文章超过1000+

2018年最新利用TCGA/GEO数据库挖掘文章列表


前几期小编给大家介绍了几篇利用GEO数据库、TCGA数据库发表的SCI论文:如:


1:An integrated lncRNA, microRNA and mRNA signature to improve prognosis prediction of colorectal cancer ,该文采用TCGA数据库中结直肠癌及癌旁组织的mRNA,lncRNA,miRNA进行差异表达,获得显著变化的分子,用于构建生存分析模型,获得疾病风险评估方法。  


2:Elevated circulating miR-182 acts as a diagnostic biomarker for early colorectal cancer,该文章利用公共数据(GEO,TCGA数据),筛选出两个miRNA(miR-182 and miR-20a)作为结直肠癌诊断的分子标志物,然后在组织和血液中进行验证,最终确定诊断参数。


3:Expression profiles analysis identifies anovel three-mRNA signature to predict overall survival in oral squamous cellcarcinoma,利用GSE13601,GSE30784, GSE37991三个mRNA芯片表达数据以及TCGA中OSCC表达数据分别做对照和患者差异基因分析及GO和KEGG通路富集分析、PPI网络分析,IPA通路分析,生存分析等,最终筛选到PLAU, CLDN8 and CDKN2A与OSCC预后相关,并且在另一个GEO数据GSE41613中得到了验证。


类似文章还有千千万,这里就不一一列举了,但仔细看来,发现这类文章具有类似的思路构架,这里我们不妨归纳一下此类文章的套路,如下:

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这类文章18年到底还好不好发?我带着这个疑问搜索了下2018年1-7月10日此类文章发表数量才发现,原来有这么多人在闷声发文章:利用GEO数据库,2018年1-7月10日期间共发表了433篇而利用TCGA数据库,1-7月间共发表文章846篇;真是不少!当你在实验室兢兢业业做实验的时候,别人就在悄无声息地利用你公开的数据,整理自己的论文!你是不是也该开开窍了呢?


小编为了大家查阅18年最新的此类文章方便,特地将2018年利用GEO数据库和TCGA数据库发表的所有文章信息整理成EXCEL;此表包含信息如下:文献题目期刊名称期刊影响因子一作姓名通讯作者姓名发表时间全文下载链接一作单位名称,如下图:(文末有索取该Excel列表的方法)

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从上表中可以看到,此类文章影响因子最高到30+,也不乏8、9,更有1以下的;这类文章比起从实验做起时间耗费要短的多,是真正的短平快类型的文章。无论你是没经费,还是没材料;是没基础,还是没思路,都可以按照以上文章思路来一篇,这一套分析下来,不仅仅一篇论文有内容了,更是开创了一个有待深入挖掘、验证的课题了。


怎么样?你是不是有点心动呢?那赶快行动起来,今年先定个小目标:两篇起步!


获取数据库文章Excel列表方法:


请先关注组学大讲堂微信公众号,然后在公众号对话框内发送 数据库文章列表” 即可获得该Excel版数据库挖掘文章列表。

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  • 发表于 2018-07-23 11:42
  • 阅读 ( 5319 )
  • 分类:TCGA

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红橙子
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