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文章 win10装docker desktop提示Installation failed: Containers Windows Feature is not available

...Access /ALLpause 然后重新安装,即可解决。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 cBioportal使用教程

...rvival绘制查看生存曲线5.通过pathway查看所分析基因的通路信息除此之外,通过cBioPortal得到的一系列分析结果都可以下载保存

问题 T2T基因组调研图中jellyfish -h和genomescope.R -m 都是设置的10000000,设置的依据是什么,不同作物有差异,怎么选择参数呢

...数据,统计出现了x(x=1,2,3…)次的kmer的数目y# -v 输出详细信息# -h 最高计数值genomescope.R -i illu.histo -o genomescope_out -p 2 -k 21 -m 10000000# -p PLOIDY,倍性# -m 最大 Kmer 覆盖阈值

问题 docker安装后,windows与虚拟机之间的数据如何挂载?

...错了。(问题1) docker的机器环境如下: docker info的信息如下: 特来请教各位大佬!!我哪个细节没注意到? 另外,为什么一开始进行blast比对,不需要给虚拟机设置cpu和内存的参数呢?到了家族分析的时候,就要先设置c...

文章 seqkit序列处理神器的常用命令

...ad            打印第一条序列help            打印帮助信息locate          定位序列,或者motifs,允许错配mutate          编辑序列(点突变、插入、删除)pair            匹配双端序列文件range           打印一个范围内的...

文章 Ka/Ks与进化选择压力

.../ks计算软件列表:PAML-yn00Kaks_calculatorK-estimator 更多生物信息课程:https://study.omicsclass.com/index

文章 linux之sed用法详解

...n∶使用silent模式。在一般 sed 的用法中,所有来自 STDIN的信息一般都会被列出到屏幕上。但如果加上 -n 参数后,则只有经过sed 特殊处理的那一行(或者动作)才会被列出来。 -e∶直接在指令列模式上进行 sed 的动作编辑; -f∶直...

文章 基因家族鉴定分析操作手册:

...视频课程:https://www.omicsclass.com/article/2260 1.下载基因组信息文件,gff,cds,pep,fasta文件: Ensembl下载地址:http://plants.ensembl.org/index.html  下载方法可参考:https://www.omicsclass.com/article/58 phytozome(JGI)下载地址:https://phytozome.jgi...

文章 CORNERSTONE,一款让你无法自拔的项目管理工具

...天、每周、每月或其他时间间隔)所需要的工时、成本等信息,从而可以更合理地调整资源在任务上的分配。 新建任务: 为了方便各位成员,分配任务,现在再也不用操作那么多的繁琐步骤,点击需要分发任务的项目组...

问题 请问,在3个数据库中进行结构域确认时,为什么我出不来和老师一样的结果,是不是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改?

结构域确认用到的序列文件: 导入Interpro后我的结果: 老师的结果: 为什么不一样呢,没有出来结构域信息

文章 腾讯云服务器获取指南

...务器后会提供给我们服务器的账号及密码,以及网络IP等信息,大家要妥善保存。如果忘记可以在未读消息里查看,方法如下: 云服务器管理 网站右上角有个“控制台”标签,点击可以进入管理界面。 在云服务器这里...

文章 第9期武汉站“基因家族分析实操培训班”开始报名了!

...码进行报名吧!有问题可以微信联系llcheng1314 优惠信息: 1. 最早确认报名的15名学员赠送价值499元2019年版《基因家族分析》视频课程;已购买过该课程的前15名报名人员,则按实际购买价折现予以优惠; 2. 团报优惠,2人...

文章 duplicate_gene_classifier统计全基因组不同类型复制事件的数目

...: 2:Dl.gff文件;是全基因组基因ID对应转录本的位置信息,如下图。染色体\t基因\t起始位点\t终止位点 命令运行屏幕会输出每种基因类型对应的数量,同时在当前目录下会生成一个.gene_type的文件,里面记录了每一个基因...

文章 WGCNA 中Relationship between module eigengenes图片绘制--plotMEpairs函数

...图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 下载TCGA基因表达量文件,应该选Count,FPKM还是FPKM-UQ ?

...例来说明两者的差别: 假设在样品1中Gene A 的相关统计信息如下:     1. Gene A的长度为:3000      2. 比对到Gene A上的reads数量:1000     3. 比对所有基因上的reads数据量:1,000,000     4. 样品1中覆盖75%基因的reads数:2000  那...