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文章 Win10家庭版也可以装Docker桌面版了！

...um >hyper-v.txtfor /f %%i in ('findstr /i . hyper-v.txt 2^>nul') do dism /online /norestart /add-package:"%SystemRoot%\servicing\Packages\%%i"del hyper-v.txtDism /online /enable-feature /featurename:Microsoft-Hyper-V-All /LimitAccess /ALL 该命令运行过程中会出现百分比（该过...

文章 R语言基础入门—判断语句

...面的代码，如果 为 false 则不执行。 实例 x <- 50Lif(is.integer(x)) {   print("X 是一个整数")} 执行以上代码，输出结果为： [1] "X 是一个整数" if...else语句 一个 if 语句后可跟一个可选的 else 语句，else 语句在布尔表达式为...

问题 blast2go注释，报错“Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom/JDOMException”，请问如何解决，详细一点

...ast2GO Pipeline Version 2.5.0 -------------------------------------- Hash for resource ec2go_19072011.txt of type ec created. 4003 associations loaded. Blast2GO build: 23092011 Change b2g-properties file to: b2gPipe.properties Blast2go.version=2.5.0 Blast2GO can not reach the Internet Blast2GO star...

问题 $python2 -m jcvi.compara.catalog ortholog ath rapa --cscore=0.7这一步报错

...catalog ortholog ath rapa --cscore=0.7 12:25:58 [cbook] File `rapa.prj` exists. Computation skipped. 12:25:58 [base] lastal -u 0 -P 48 -i3G -f BlastTab rapa ath.cds >./ath.rapa.last 12:26:05 [synteny] Assuming --qbed=ath.bed --sbed=rapa.bed 12:26:05 [base] Load file `ath.bed` 12:26:05 [base]...

文章 基因组重复序列分类 转座子

...[6]。此外，转座子也可分为插入序列（insertional sequence，IS）、复合转座子和复杂转座子。一些常见植物基因组大小、不同类型转座子数量，见表 1。 Chromosome Res. 2015 Sep;23(3):415-20. doi: 10.1007/s10577-015-9499-z. PMID: 26514350. 何...

文章 KEGG富集分析弦图绘制

...可以看到一些比较复杂的弦图，比如说《A simplified herbal formula for the treatment of heart failure: Efficacy, bioactive ingredients, and mechanisms》这篇论文中的弦图（下图所示），首先该图总体想要传递的信息为不同基因所对应的KEGG通路，其次...

文章 绘制Upset 图

...,"devtools")# 判断R包加载是否成功来决定是否安装后再加载for(p in package_list){if(!suppressWarnings(suppressMessages(require(p, character.only = TRUE, quietly = TRUE, warn.conflicts = FALSE)))){install.packages(p, warn.conflicts = FALSE)suppressWarnings(suppressMessages(libr...

文章 免疫 侵润 分析 ESTIMATE分析

...utput:   html_document:     toc: true     theme: united date: '`r format(Sys.time(),"%d %B, %Y")`' --- ![image](https://note.youdao.com/yws/api/group/92990402/noteresource/D0C43D04435648A4A5A9B36556716345/version/421?method=get-resource&shareToken=76A1AE2F0EB444EB93D783F84996259...

文章 亚型划分比较波浪图（桑基图）绘制

...有时会看到她的身影。 比如在一篇2021年发表于The Journal for ImmunoTherapy of Cancer上的影响因子为13.75的文献《m6A modification patterns and tumor immune landscape in clear cell renal carcinoma》中，作者利用桑基图来描绘m6A簇、免疫亚型和m6A score的变...

文章 基因家族分析课程更新-批量进行kaks计算

...., Zhang, H., Liu, G., Wang, X. and Dai, L. (2012) ParaAT: A parallel tool for constructing multiple protein-coding DNA alignments, Biochem Biophys Res Commun, 419(4):779-7

文章 TCGA SNV 体细胞突变下载

...################package_list <- c("TCGAbiolinks","tidyverse","maftools")for(p in package_list){  if(!suppressWarnings(suppressMessages(require(p, character.only = TRUE, quietly = TRUE, warn.conflicts = FALSE)))){    if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))      install.packages...

文章 MYSQL数据库常用语句命令

...me VARCHAR(10));CREATE TABLE m(id INT, name VARCHAR(10), PRIMARY KEY (id), FOREIGN KEY (id) REFERENCES n(id), UNIQUE (name));CREATE TABLE m(id INT, name VARCHAR(10));# 直接将查询结果导入或复制到新创建的表CREATE TABLE n SELECT * FROM m;# 新创建的表与一个存在的表的数据...

文章 胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-糖酵解

...，对于生存期<30天的样本进行删除，最终：1,140 patients for analysis, including 337 patients from TCGA and 803 patients from GEO。糖酵解相关基因集：从Molecular Signatures Database v4.0数据库中筛选与糖酵解相关的基因集5个：BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY, GO...

文章 相关系数小结

...nk系数不同，后者并不需要线性相关这个条件。 Kendall Tau is a statistic used to measure the ordinal association between two measured quantities.直接看公式比较容易理解： /2}) 即有序对儿(nc)的数量...

问题 Admixture算STRUCTURE，出来的CV erro值随着K增大而递增是怎么回事，算了好几组数据都这样

...-allow-extra-chr  --keep-allele-order #admixture 群体结构分析 for k in {2..8};do     echo "admixture -j2 -C 0.01 --cv admixture.ped $k >admixture.log$k.out"     admixture -j2 -C 0.01 --cv admixture.ped $k >admixture.log$k.out done 结果基本都这样admixture.log2.ou...