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问题 Gc view 作图软件

老师,我想请教一下您关于gcviewer作图软件的问题,为什么下载完作图软件后,用Java打不开呢?先谢过老师。

问题 tassel 报错#文件格式转换

ERROR net.maizegenetics.dna.map.PositionListBuilder

文章 启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库!

...护mRNA,免受核酸外切酶攻击,并且对转录终结、将mRNA从细胞核输出及进行翻译都十分重要;PolyA尾巴是mRNA转录后修饰加上去的,DNA基因序列中是不存在的,经mRNA反转录出的cDNA是有PolyA结构的。 7.  CDS与ORF:这是一个经常被人...

文章 GenePred格式

GenePred格式主要用于基因浏览器中基因预测的track。 如果有可变剪切的情况,那表格的每一行就是一个 transcript 的全部信息。 格式如下: #gpd AT1G01010.1 Chr1 + 3630 5899 3759 5630 6 3630,3995,4485,4705,5173,5438, 3913,4276,460...

问题 docker镜像中的软件列表如何查看?

...析等整套分析流程,进入run it (ID)后,不记得都有哪些软件了,不想回去看视频的话,有什么方法快速找到软件列表? 另外,如果不是omicsclass的第三方镜像是否有类似的方法查看软件列表?

问题 生物信息学分析软件

想学习一些分析DNA进化,起源、适应、synteny, 插入、重排、掉失、获得、二倍化、基因转录方向、排列顺序、启动子活性等的分析软件,但不知都涉及哪些软件,还望指点!有赏金!

文章 三代数据SV检测软件安装与使用——cuteSV

...结构变异方面有着很大的优势,但是由于数据分析算法、软件还处于不断开发更新中,当前还没有公认推荐的软件。这里为大家推荐一款国人开发的三代数据SV检测软件—cuteSV。该软件同时支持目前三代测序领域的两大平台PacBio...

文章 使用map()、filter()来做到函数式编程

...会改变原列表了 切入正题,先介绍一下map(),他的格式是 map(function, iterable) function可以是内置函数、自定义函数或匿名函数; iterable表示一个或多个可迭代对象,可以是列表、字符串等 map()功能是对可迭代对象全部调...

文章 singleR细胞注释PBMC

##调用第三方包 library(SingleR) library(celldex) library(qs) library(Seurat) ##备份 setwd("~/pbmc/04.cell_type_ann/") pbmc=qread("pbmc.added.celltype.qs") pbmc_singleR <- pbmc ##载入参考数据集 MID <- MonacoImmuneData() ##提取表达矩阵 pbmc_count <- GetA...

问题 老师,您好,我想请问一下,conet分析时,如果不加环境因子的时候可以正常运行,但是加上环境因子就不行,想问一下是什么原因?下面是我环境因子的格式,我用notepad++转换成文本格式

fatures.xlsx

文章 组学生物招贤纳士!

...历 2. 有亲和力、善于沟通、积极主动 3. 熟练使用办公软件及网络 4. 熟练阅读英文文献,独立设计生物实验 5. 高通量测序相关实验或从业者优先 产品部-产品经理(若干) 工作地点:北京亦庄 一、职位描述: 1. 完成产品...

文章 cytoscape软件安装与使用-绘制蛋白互作网络图

1.cytoscape软件安装 1.java JDK安装,建议jdk 8,安装方法:https://www.omicsclass.com/article/2982.cytoscape软件下载安装,必须上一步java jdk安装完成之后才可以安装cytoscape软件,因为cytoscape软件为java软件。https://cytoscape.org/ 2.基本使用,网...

问题 GWAS分析转换hapmap格式报错

文章 细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中

        选取需要的列,之前有的相同的列信息去除。保留第一列barcode,方便合并; cut -f 1,27- UCell.metadata.tsv >UCell.metadata1.tsvcut -f 1,27- infercnv.metadata.tsv >infercnv.metadata1.tsvcut -f 1,27- CytoTRACE2.metadata.tsv >CytoTRACE2.metadata1....

文章 抗体开发过程中的常见问题及解决方案详解

...题一:应如何确定选择单抗还是多抗定制? 多抗是多个B细胞克隆产生的针对多种抗原表位的多种抗体混合物,单抗是一个B细胞克隆产生的针对一种抗原表位的的单一抗体。 对抗体的特异性要求高,用量较大或需要长期使用一...